RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498438.1

HOXD11-202, Transcript of homeobox D11, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXD11, Length 1,259 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-202ENST00000498438 KIAA0319Q5VV43 1072 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 KIAA1841Q6NSI8 718 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 PPFIBP1Q86W92 1011 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 ZHX3Q9H4I2 956 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 DZANK1Q9NVP4 752 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 CDH22Q9UJ99 828 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 SSX2IPQ9Y2D8 614 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 PLXNA3P51805 1871 aa20.15■□□□□ 0.82
HOXD11-202ENST00000498438 SF3B1O75533 1304 aaKnown RBP eCLIP20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 TEX28O15482 410 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 TADA2AO75478 443 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CLCN4P51793 760 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 USP41Q3LFD5 358 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RRAGBQ5VZM2 374 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ZPBP2Q6X784 338 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 KCNN1Q92952 543 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 BICD1Q96G01 975 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SNX27Q96L92 541 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PHF7Q9BWX1 381 aaPredicted RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CHST7Q9NS84 486 aa20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 TFIP11Q9UBB9 837 aaKnown RBP20.14■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 TRAK2O60296 914 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ITIH3Q06033 890 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ALKAL1Q6UXT8 129 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 FBXL18Q96ME1 805 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ACAP3Q96P50 834 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 FIZ1Q96SL8 496 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ADAM7Q9H2U9 754 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RXFP1Q9HBX9 757 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 TBX20Q9UMR3 447 aa20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PDCD11Q14690 1871 aaKnown RBP20.13■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 VWA8A3KMH1 1905 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 A0A087X0B3 334 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PI4K2BG5E9Z4 385 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SPTLC2O15270 562 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CLDN3O15551 220 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 F13A1P00488 732 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ADH1AP07327 375 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SCP2P22307 547 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 MCL1Q07820 350 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PKP1Q13835 747 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SEZ6Q53EL9 994 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 XKR4Q5GH76 650 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CES5AQ6NT32 575 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 DYMQ7RTS9 669 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 C1QTNF1Q9BXJ1 281 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 HAPLN2Q9GZV7 340 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa20.12■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 MYMKA6NI61 221 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SPDYE4A6NLX3 237 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 LOC730098B7Z3J9 87 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 WEE2P0C1S8 567 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 NMT1P30419 496 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 STAT6P42226 847 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 LIG4P49917 911 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CLCNKBP51801 687 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SOX4Q06945 474 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RTP2Q5QGT7 225 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 KANK3Q6NY19 840 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SV2BQ7L1I2 683 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 DDX12PQ92771 950 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 UROC1Q96N76 676 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PANK2Q9BZ23 570 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SFXN1Q9H9B4 322 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 CNTN3Q9P232 1028 aa20.11■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PPP6R2O75170 966 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 YEATS4O95619 227 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 GLUD1P00367 558 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PIGRP01833 764 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RPL17P18621 184 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 UPP1Q16831 310 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 FAM171A1Q5VUB5 890 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 TMC5Q6UXY8 1006 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 SFR1Q86XK3 245 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 RNF135Q8IUD6 432 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 GLYCTKQ8IVS8 523 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 GPR65Q8IYL9 337 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 FEZF2Q8TBJ5 459 aa20.1■□□□□ 0.81
HOXD11-202ENST00000498438 TTPALQ9BTX7 342 aa20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms