RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380641.4

CNTLN-201, Transcript of centlein, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene CNTLN, Length 4,871 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLN-201ENST00000380641 FIGNQ5HY92 759 aa14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 SCN4BQ8IWT1 228 aa14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 TLK1Q9UKI8 766 aa14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 IFT172Q9UG01 1749 aa14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 BACE1P56817 501 aa14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 USP38Q8NB14 1042 aa14.52□□□□□ -0.08
CNTLN-201ENST00000380641 KRT37O76014 449 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 RGS7P49802 495 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 Q4G0T1 1027 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 C1orf228Q6PIY5 440 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 GPRASP2Q96D09 838 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 ANKRD26Q9UPS8 1709 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 VGLL3A8MV65 326 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 MYO1CO00159 1063 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 GPC4O75487 556 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SPARCL1Q14515 664 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 C2CD6Q53TS8 623 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SPATA24Q86W54 205 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 CERS5Q8N5B7 392 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 OR6J1Q8NGC5 347 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 AKT1S1Q96B36 256 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 VCX3BQ9H321 246 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PIN4Q9Y237 131 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa14.52□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 GMNCA6NCL1 334 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SYCP2LQ5T4T6 812 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 XRRA1Q6P2D8 792 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TRIM42Q8IWZ5 723 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PPM1NQ8N819 430 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 ATL2Q8NHH9 583 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 MCEEQ96PE7 176 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 CYP26B1Q9NR63 512 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TRAPPC11Q7Z392 1133 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 CPSF3Q9UKF6 684 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 C3P01024 1663 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SLC1A1P43005 524 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TBC1D1Q86TI0 1168 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 BBS5Q8N3I7 341 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 CHST13Q8NET6 341 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 MAML1Q92585 1016 aa14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 IPO11Q9UI26 975 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TCF7P36402 384 aaPredicted RBP14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 NPTX2P47972 431 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 NME3Q13232 169 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 HPCAL4Q9UM19 191 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 FIS1Q9Y3D6 152 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TACC3Q9Y6A5 838 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 ARHGEF37A1IGU5 675 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 EXTL3O43909 919 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PHF2O75151 1096 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 THOC5Q13769 683 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 C9orf72Q96LT7 481 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PDCD2LQ9BRP1 358 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 IDI2Q9BXS1 227 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 A0A0G2JND7 137 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 P4HA2O15460 535 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 RFC5P40937 340 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 WNT7AO00755 349 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 COPEO14579 308 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 ZBTB39O15060 712 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 GRAP2O75791 330 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 LCP1P13796 627 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SOX10P56693 466 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 MTM1Q13496 603 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 ATF7IP2Q5U623 682 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SPOPLQ6IQ16 392 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 JAMLQ86YT9 394 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TEX2Q8IWB9 1127 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 HDAC11Q96DB2 347 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 VIPAS39Q9H9C1 493 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 GAKO14976 1311 aa14.5□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 RARBP10826 455 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SENP7Q9BQF6 1050 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 STAP1Q9ULZ2 295 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 LPXNO60711 386 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 PDGFRAP16234 1089 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 SLC8A1P32418 973 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 NLRP14Q86W24 1093 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 MMGT1Q8N4V1 131 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.49□□□□□ -0.09
CNTLN-201ENST00000380641 TTC25Q96NG3 672 aa14.49□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.5 ms