RNA–Protein interactions for RNA: YPL178W

CBC2, Transcript of Small subunit of the heterodimeric cap binding complex with Sto1p, yeast

Gene CBC2, Length 627 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CBC2	YPL178W	SAM50	P53969	484 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	ASI3	P53983	676 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	TIM10	P87108	93 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	YDR514C	Q04408	483 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	FIT3	Q08907	204 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	RBD2	Q12270	262 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	YOL114C	Q12322	202 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	YPR1	Q12458	312 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	DSF1	P0CX08	502 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	DBF2	P22204	572 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	BOS1	P25385	244 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	BUD23	P25627	275 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	AHC2	P25649	128 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	VPS17	P32913	551 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	CLB6	P32943	380 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	YKR015C	P36111	568 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	YFL051C	P43552	160 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	YJL016W	P47072	561 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	SLI1	P53304	468 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	PAU12	P53343	120 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	GPI17	Q04080	534 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	GAL83	Q04739	417 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	MRX10	Q05648	414 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	PML1	Q07930	204 aa	Predicted RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	MED7	Q08278	222 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	SOG2	Q08817	791 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	TGS1	Q12052	315 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CBC2	YPL178W	TDH3	P00359	332 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.65	□□□□□ -1.67	not detected
CBC2	YPL178W	YCL042W	P25572	119 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	DBF20	P32328	564 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	FRM2	P37261	193 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	THI2	P38141	450 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	IES5	P40060	125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	PUG1	P40100	303 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	DLS1	P40366	167 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	QDR1	P40475	563 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	GDS1	P41913	522 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	UBC13	P52490	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	PPT1	P53043	513 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	NRK1	P53915	240 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	CRZ1	P53968	678 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YLR152C	P54072	576 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	MCM21	Q06675	368 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	BRE4	Q07660	1125 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YLR031W	Q07978	186 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	RNH203	Q12338	110 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	BBP1	Q12365	385 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	FRE6	Q12473	712 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	SPO24	Q3E752	67 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	COX5B	P00425	151 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	COX9	P07255	59 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	PAU24	P38155	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	PEX32	P38292	413 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	PMT6	P42934	759 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	EFM3	P47163	339 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	MTL1	P53214	551 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YNR048W	P53740	393 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	AAH1	P53909	347 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YPL077C	Q02831	240 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	MAK3	Q03503	176 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YDR391C	Q04170	232 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	API2	Q04413	109 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YPR196W	Q06595	470 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	RSC58	Q07979	502 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	FRE3	Q08905	711 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	SRL2	Q12020	392 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	not detected
CBC2	YPL178W	USB1	Q12208	290 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	SOD2	P00447	233 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	MET3	P08536	511 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	DOA4	P32571	926 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	SPC29	P33419	253 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YKL107W	P34251	309 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	MTH1	P35198	433 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	RCN1	P36054	211 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	FMP23	P38231	175 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	ALG14	P38242	237 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YHL044W	P38727	235 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	RRF1	P38771	230 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	JLP2	P40206	208 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	SLS1	P42900	643 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	CTK2	P46962	323 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	YGL204C	P53089	101 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	PEX30	Q06169	523 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CBC2	YPL178W	GPN3	Q06543	272 aa		4.63	□□□□□ -1.67

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