RNA–Protein interactions for RNA: YOR116C

RPO31, Transcript of RNA polymerase III largest subunit C160, yeast

Gene RPO31, Length 4,383 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RPO31	YOR116C	VTS1	Q08831	523 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.54	□□□□□ -1.84	not detected
RPO31	YOR116C	LEA1	Q08963	238 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MMT2	Q08970	484 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SUC2	P00724	532 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HEM4	P06174	275 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PRB1	P09232	635 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HSP12	P22943	109 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YCR101C	P25607	182 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	THI80	P35202	319 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DCW1	P36091	449 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PAU24	P38155	120 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CAT5	P41735	233 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ATG27	P46989	271 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ERV14	P53173	138 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PPZ2	P33329	710 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GPX1	P36014	167 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TAT2	P38967	592 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SYS1	P41544	203 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SMK1	P41808	388 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CTK2	P46962	323 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	IKS1	P47042	667 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TDA7	P53882	636 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RHO4	Q00246	291 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EMI1	Q04406	187 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TRI1	Q05024	226 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ENV7	Q12003	364 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EAF3	Q12432	401 aa		3.54	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TPI1	P00942	248 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	EPT1	P22140	391 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ARO2	P28777	376 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MKK2	P32491	506 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RMA1	P36001	430 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ECM8	P38246	354 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HEM14	P40012	539 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	COA1	P40452	197 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YKE4	P40544	346 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MSL1	P40567	111 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	NIT2	P47016	307 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TTI2	P47168	421 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HXT16	P47185	567 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TIM21	P53220	239 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DIA1	P54005	336 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	TIR4	Q12218	487 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MAK32	P23060	363 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PRE4	P30657	266 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SRB5	P32585	307 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MSN2	P33748	704 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ERV15	P38312	142 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	FLX1	P40464	311 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CFD1	P40558	293 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ULI1	P43604	169 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PTR3	P43606	678 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HIT1	P46973	164 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YJR149W	P47177	404 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SKP1	P52286	194 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ERG25	P53045	309 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YGR126W	P53274	230 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RCE1	Q03530	315 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YDL129W	Q07555	291 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	POM34	Q12445	299 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	ZPS1	Q12512	249 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DFG16	Q99234	619 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	BET2	P20133	325 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	DEG1	P31115	442 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	COQ2	P32378	372 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	CSE2	P33308	149 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	MUP3	P38734	546 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	PCL5	P38794	229 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	RRT5	P43607	289 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	HRT1	Q08273	121 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YOR105W	Q08504	108 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	GEP3	Q08622	556 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YOR015W	Q12169	119 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		3.53	□□□□□ -1.84
RPO31	YOR116C	SOD2	P00447	233 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YOL163W	P0CF20	169 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YGL010W	P25338	174 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PRY2	P36110	329 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MRPL28	P36527	147 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YHR138C	P38841	114 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YEL020C	P39994	560 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YER010C	P40011	234 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YJR154W	P47181	346 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YGL118C	P53132	145 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	DUO1	P53168	247 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	ABF2	Q02486	183 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	MRX8	Q05473	314 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	DCS1	Q06151	350 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	YDL176W	Q12027	708 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.52	□□□□□ -1.85	not detected
RPO31	YOR116C	RTN2	Q12443	393 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	FRE6	Q12473	712 aa		3.52	□□□□□ -1.85
RPO31	YOR116C	UBA3	Q99344	299 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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