RNA–Protein interactions for RNA: YOL091W

SPO21, Transcript of Component of the meiotic outer plaque of the spindle pole body, yeast

Gene SPO21, Length 1,830 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO21	YOL091W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	DOA4	P32571	926 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PEP8	P40335	379 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	NIF3	P53081	288 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MGR3	Q04472	501 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SFH1	Q06168	426 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.52	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	EHD3	P28817	500 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SCM4	P32564	187 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SFC1	P33303	322 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	DRE2	P36152	348 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	LOH1	P47055	219 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	CPD1	P53314	239 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	DAD3	P69850	94 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PRM15	Q03262	622 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	ERV41	Q04651	352 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.51	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SGA1	P08019	549 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	ECM13	P38195	257 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.5	□□□□□ -2.33	not detected
SPO21	YOL091W	CTR2	P38865	189 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	AGX1	P43567	385 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	TAD2	P47058	250 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SEC10	Q06245	871 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	GPN3	Q06543	272 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	STF1	P01098	86 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YKL070W	P36087	169 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	RCY1	P39531	840 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YIA6	P40556	373 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	KEL2	P50090	882 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MNT4	P53745	580 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YNL050C	P53952	270 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PEX12	Q04370	399 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	BOP2	Q06150	570 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	FMP16	Q12497	93 aa		0.5	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YSR3	P23501	404 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MAL32	P38158	584 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	HSM3	P38348	480 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MAL12	P53341	584 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YNL260C	P53846	198 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MHT1	Q12525	324 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YOS9	Q99220	542 aa		0.49	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PEX3	P28795	441 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	RNP1	P32385	249 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YKR045C	P36138	183 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MRPL40	P36534	297 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	DSE2	P38844	325 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	TEM1	P38987	245 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PRM9	P39551	298 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YER135C	P40082	130 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	COA1	P40452	197 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SNX4	P47057	423 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MAL13	P53338	473 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	AAH1	P53909	347 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SPP2	Q02521	185 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	CTF19	Q02732	369 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	BCP1	Q06338	283 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SAS5	Q99314	248 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SWI1	P09547	1314 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	CDC7	P06243	507 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YBR096W	P38256	230 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	YLR413W	Q06689	675 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PST1	Q12355	444 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	EMP46	Q12396	444 aa		0.48	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	CCA1	P21269	546 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	SEC22	P22214	214 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	MSA2	P36157	363 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	TDA11	P38854	504 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.47	□□□□□ -2.33	not detected
SPO21	YOL091W	ASI3	P53983	676 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	CTR3	Q06686	241 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	PER33	Q12144	273 aa		0.47	□□□□□ -2.33
SPO21	YOL091W	COX5A	P00424	153 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	QRI5	P32344	111 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	RRF1	P38771	230 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	GLE2	P40066	365 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	OST2	P46964	130 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	OST6	Q03723	332 aa		0.46	□□□□□ -2.34
SPO21	YOL091W	PEX10	Q05568	337 aa		0.46	□□□□□ -2.34

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