RNA–Protein interactions for RNA: YML043C

RRN11, Transcript of Component of the core factor (CF) rDNA transcription factor complex, yeastyeast

Gene RRN11, Length 1,524 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RRN11YML043C VTS1Q08831 523 aaKnown RBP RIP-Chip data3.91□□□□□ -1.78not detected
RRN11YML043C FSF1Q12029 327 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YDL177CQ12257 170 aa3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C PST1Q12355 444 aa3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C ISA2Q12425 185 aa3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C EAF3Q12432 401 aa3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C AIM45Q12480 344 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YLR099W-AQ3E798 87 aa3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C SUS1Q6WNK7 96 aa3.91□□□□□ -1.78
RRN11YML043C THP2O13539 261 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YEL076C-AP0CX16 216 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YLR464WP0CX17 216 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C ERD1P16151 362 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YCR061WP25639 631 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C MRPL6P32904 214 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C MSN2P33748 704 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C MTH1P35198 433 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C TMA19P35691 167 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data3.9□□□□□ -1.78not detected
RRN11YML043C POP8P38208 133 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C MUP3P38734 546 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C WSC4P38739 605 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YEL076CP39971 216 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C SNU13P39990 126 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C RFC4P40339 323 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C LRO1P40345 661 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C CAK1P43568 368 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C ZAP1P47043 880 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C PET130P47065 347 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C PHB2P50085 310 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C SBH2P52871 88 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C EXG2P52911 562 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YGL114WP53134 725 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C SGF73P53165 657 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YGR066CP53242 292 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C ATG4P53867 494 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C ARA2Q04212 335 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C YDR222WQ04925 415 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C ASM4Q05166 528 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C CSI2Q08054 341 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C FCF2Q12035 217 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C RGT2Q12300 763 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C JLP1Q12358 412 aa3.9□□□□□ -1.78
RRN11YML043C TPI1P00942 248 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C SAG1P20840 650 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C SEC22P22214 214 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C RBK1P25332 333 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C STE50P25344 346 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C ADH7P25377 361 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C PRP45P28004 379 aaPredicted RBP3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C MF(ALPHA)2P32435 120 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C ARO4P32449 370 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C SFC1P33303 322 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YHL044WP38727 235 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C HPA3P39979 161 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C SPG5P42933 373 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C DIA3P52290 468 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C STR3P53101 465 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YIP3P53633 176 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C FMP41P53889 259 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C GPI15P53961 229 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C RHO4Q00246 291 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C GOT1Q03554 138 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C CCE1Q03702 353 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YMR155WQ03795 547 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YMR130WQ04223 302 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C TRM12Q04235 462 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C CNL1Q06333 122 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C TPO3Q06451 622 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C ANT1Q06497 328 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YLR413WQ06689 675 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C ENT4Q07872 247 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C MMT2Q08970 484 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C UPC2Q12151 913 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C SKS1Q12505 502 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C CTF3Q12748 733 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YCR075W-AQ3E830 75 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C HRP1Q99383 534 aaKnown RBP3.9□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YRF1-3P0CX14 1859 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YRF1-7P0CX15 1859 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YRF1-6P53819 1859 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C SAL1D6W196 494 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C PEP4P07267 405 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C RPL27AP0C2H6 136 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C RPL27BP0C2H7 136 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C NHP6BP11633 99 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C GCY1P14065 312 aaKnown RBP RIP-Chip data3.89□□□□□ -1.79not detected
RRN11YML043C AMD1P15274 810 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C MDH1P17505 334 aaKnown RBP RIP-Chip data3.89□□□□□ -1.79not detected
RRN11YML043C DAL82P21705 255 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C LSB5P25369 354 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C URK1P27515 501 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C KKQ8P36004 724 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C DER1P38307 211 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C YEL057CP39983 233 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C COX15P40086 486 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C LSM5P40089 93 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C FLX1P40464 311 aa3.89□□□□□ -1.79
RRN11YML043C LYS12P40495 371 aaKnown RBP3.89□□□□□ -1.79
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