RNA–Protein interactions for RNA: YLR456W

YLR456W, Transcript of Putative pyridoxal 5'-phosphate synthase, yeast

Gene YLR456W, Length 615 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YLR456W	YLR456W	MRPS8	Q03799	155 aa		0.78	□□□□□ -2.28
YLR456W	YLR456W	DSF1	P0CX08	502 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	SMD3	P43321	101 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	ATC1	Q04005	294 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	YLR297W	Q05899	129 aa		0.77	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.77	□□□□□ -2.29	not detected
YLR456W	YLR456W	PRM10	P42946	383 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	LOH1	P47055	219 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	KEL2	P50090	882 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	CYT2	Q00873	224 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	PEX10	Q05568	337 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	SEC10	Q06245	871 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	SLD7	Q08457	257 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		0.76	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	UIP5	P36137	443 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	AVT2	P39981	480 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	SER33	P40510	469 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	ERG25	P53045	309 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	0.75	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	CSI2	Q08054	341 aa		0.75	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	PET18	P25362	215 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	TDA11	P38854	504 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	RCY1	P39531	840 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	AGP3	P43548	558 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	PEX31	P53203	462 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	YNL050C	P53952	270 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	YOS9	Q99220	542 aa		0.74	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	YHR032W-A	P0C5N6	59 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	CWP1	P28319	239 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.73	□□□□□ -2.29	not detected
YLR456W	YLR456W	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	YHR022C	P38763	256 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	SSO2	P39926	295 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	GPN3	Q06543	272 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	ATO3	Q12359	275 aa		0.73	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	DDI2	P0CH63	225 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	DDI3	P0CH64	225 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	SWI3	P32591	825 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	PRM9	P39551	298 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	VPS20	Q04272	221 aa		0.72	□□□□□ -2.29
YLR456W	YLR456W	ICL1	P28240	557 aa	Predicted RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	RCN1	P36054	211 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	APE4	P38821	490 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	YLR162W	Q06235	118 aa		0.71	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	SPT7	P35177	1332 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.7	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	YHL049C	P38722	271 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	ARC15	P40518	154 aa	RIP-Chip data	0.7	□□□□□ -2.3	not detected
YLR456W	YLR456W	VOA1	P53262	265 aa		0.7	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	Q0255	P03881	472 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	BUD25	P85052	153 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	ABZ2	Q03266	374 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	SFH1	Q06168	426 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	CTR3	Q06686	241 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	AKR2	Q12013	749 aa		0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.69	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	GPI12	P23797	304 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	SHC1	P39000	512 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	CTF19	Q02732	369 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	EMP46	Q12396	444 aa		0.68	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	SEC22	P22214	214 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	CSM1	P25651	190 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	UPS2	P35200	230 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.67	□□□□□ -2.3	not detected
YLR456W	YLR456W	HIS2	P38635	335 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	COS8	P38723	381 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	CTR2	P38865	189 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	NBP35	P52920	328 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	YGR026W	P53217	278 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	CPD1	P53314	239 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	SWS2	P53937	143 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	YDR286C	Q05530	114 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	RRG8	Q06109	277 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	VAC14	Q06708	880 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	YPR011C	Q12251	326 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	BBP1	Q12365	385 aa		0.67	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	UGA1	P17649	471 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	TRX1	P22217	103 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	RPC25	P35718	212 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	YNR062C	P53748	327 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	CUR1	Q06469	252 aa		0.66	□□□□□ -2.3
YLR456W	YLR456W	ERV15	P38312	142 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YLR456W	YLR456W	TCD1	P38756	429 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YLR456W	YLR456W	YKE4	P40544	346 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YLR456W	YLR456W	YJR079W	P47126	109 aa		0.65	□□□□□ -2.31
YLR456W	YLR456W	YGR219W	P53307	113 aa		0.65	□□□□□ -2.31

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 30.8 ms