RNA–Protein interactions for RNA: YLR144C

ACF2, Transcript of Intracellular beta-1,3-endoglucanase, yeast

Gene ACF2, Length 2,340 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ACF2	YLR144C	PCL1	P24867	279 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	DOA4	P32571	926 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.9	□□□□□ -1.62	not detected
ACF2	YLR144C	PSD1	P39006	500 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	PKP1	P40530	394 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	IDS2	P46958	469 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	TPN1	P53099	579 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	YGR042W	P53227	271 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	NRM1	P53718	249 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	YLR352W	Q06479	807 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	YEH1	Q07804	573 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	USV1	Q12132	391 aa		4.9	□□□□□ -1.62
ACF2	YLR144C	SEC12	P11655	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	PAU2	P32612	120 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	SEF1	P34228	1148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YKL071W	P36086	256 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MRPL15	P36523	253 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YPT10	P38146	199 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	FMP48	P53233	369 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YAP1802	P53309	568 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MRPL50	P53724	139 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	TMS1	Q12116	473 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	INP53	Q12271	1107 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	COX17	Q12287	69 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	FRE6	Q12473	712 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MTR10	Q99189	972 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	PRB1	P09232	635 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	CNE1	P27825	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	RTT105	P40063	208 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YER137C	P40083	148 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	PMT6	P42934	759 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MDE1	P47095	244 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	AIM25	P47140	327 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YIP4	P53093	235 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	VHT1	P53241	593 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	NUP116	Q02630	1113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	PEX25	Q02969	394 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	HMS1	Q12398	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	RDI1	Q12434	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	TRA1	P38811	3744 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	OPI3	P05375	206 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	SPS2	P08459	502 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	NUP1	P20676	1076 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YCR061W	P25639	631 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	ATS1	P31386	333 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	SFK1	P35735	353 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	GPX1	P36014	167 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	APD1	P38281	316 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	SYG1	P40528	902 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YGR151C	P53287	111 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	SFG1	Q12507	346 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	GLK1	P17709	500 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	NAM9	P27929	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	VBA2	P38358	474 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MNN5	P46982	586 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	PET191	Q02772	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	GIS1	Q03833	894 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YDR102C	Q03864	110 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MRX8	Q05473	314 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	CTS2	Q06350	511 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	RLM1	Q12224	676 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YOR343C	Q12484	108 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YIL046W-A	Q3E7Z4	54 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	TAD3	Q9URQ3	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	STE12	P13574	688 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	STE4	P18851	423 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	VPS17	P32913	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	COS9	P36034	407 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.88	□□□□□ -1.63	not detected
ACF2	YLR144C	UBX6	P47049	396 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	ATG21	Q02887	496 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	KEI1	Q06346	221 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YDL086W	Q07505	273 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MCP1	Q12106	302 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	FRE7	Q12333	620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	BBP1	Q12365	385 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	ITR1	P30605	584 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	SPT10	P35208	640 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	RFC4	P40339	323 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	YIL060W	P40519	144 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	HEM25	Q07534	307 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ACF2	YLR144C	COQ10	Q08058	207 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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