RNA–Protein interactions for RNA: YLL009C

COX17, Transcript of Copper metallochaperone that transfers copper to Sco1p and Cox11p, yeast

Gene COX17, Length 210 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
COX17	YLL009C	DDI3	P0CH64	225 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	MRP2	P10663	115 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	TFS1	P14306	219 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	PHO80	P20052	293 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	HCM1	P25364	564 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	OAC1	P32332	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	PHA2	P32452	334 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	ROT2	P38138	954 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	ARC40	P38328	384 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	AIM2	P39721	246 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	YIL067C	P40514	678 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	YJR015W	P47090	510 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	HCH1	P53834	153 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	MRX11	Q03079	207 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	UTP15	Q04305	513 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	IRC10	Q08118	586 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	MCH4	Q08268	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	UTP23	Q12339	254 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	YPR064W	Q12492	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	MHT1	Q12525	324 aa		4.97	□□□□□ -1.61
COX17	YLL009C	EDE1	P34216	1381 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RAD52	P06778	471 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SPO12	P17123	173 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RSA4	P25382	515 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ARO7	P32178	256 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SAC1	P32368	623 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PHD1	P36093	366 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	HAC1	P41546	238 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	GLC8	P41818	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	BIR1	P47134	954 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TIM13	P53299	105 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YNL092W	P53934	400 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YLR049C	Q12110	428 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	HRT3	Q12347	344 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.96	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	DRS2	P39524	1355 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MET2	P08465	486 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	GCN3	P14741	305 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PHO13	P19881	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PEX34	P25584	144 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CDC50	P25656	391 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MET22	P32179	357 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	HYM1	P32464	399 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	UGX2	P32772	223 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	FRE2	P36033	711 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YKL075C	P36083	450 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RIM2	P38127	377 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YBR137W	P38276	179 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	COS8	P38723	381 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ECM14	P38836	430 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SPL2	P38839	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	AIM18	P38884	321 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	LYS1	P38998	373 aa	RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
COX17	YLL009C	MST28	P39552	234 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TOS2	P50078	622 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YIP4	P53093	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YGL039W	P53183	348 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YGR035C	P53222	116 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SMM1	P53720	384 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ERG5	P54781	538 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YDL009C	Q12210	107 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YDR461C-A	Q2V2P7	80 aa		4.95	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RPO31	P04051	1460 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TCB3	Q03640	1545 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	COX5A	P00424	153 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SUC2	P00724	532 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CDC7	P06243	507 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	HAP2	P06774	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MRS1	P07266	363 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ALG7	P07286	448 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CNB1	P25296	175 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MRP49	P32388	137 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	AEP1	P32493	518 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TOA2	P32774	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SFC1	P33303	322 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YBR220C	P38318	560 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YPT35	P38815	214 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CHL4	P38907	458 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	YAE1	P47118	141 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MCM22	P47167	239 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	LYS5	P50113	272 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	PCP1	P53259	346 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	SPR6	Q01684	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ELP3	Q02908	557 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	RSC9	Q03124	581 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	NHP10	Q03435	203 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	FMN1	Q03778	218 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	ATG39	Q06159	398 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	CNL1	Q06333	122 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	MMT2	Q08970	484 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	TAF10	Q12030	206 aa		4.94	□□□□□ -1.62
COX17	YLL009C	BUD4	P47136	1447 aa		4.94	□□□□□ -1.62

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