RNA–Protein interactions for RNA: YKR087C

OMA1, Transcript of Metalloendopeptidase of the mitochondrial inner membrane, yeast

Gene OMA1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
OMA1	YKR087C	LSB1	P53281	241 aa		2.72	□□□□□ -1.97
OMA1	YKR087C	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		2.72	□□□□□ -1.97
OMA1	YKR087C	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MRPL37	P36532	105 aa		2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SHC1	P39000	512 aa		2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	GON7	P46984	123 aa		2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	TAD2	P47058	250 aa		2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	NUP84	P52891	726 aa		2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	CWC21	Q03375	135 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	KAP95	Q06142	861 aa	Known RBP	2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	YOR268C	Q08734	132 aa		2.71	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SSA3	P09435	649 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MET16	P18408	261 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	PET100	P38958	111 aa		2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	YJL028W	P47062	111 aa		2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	LIA1	P47120	325 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SLM2	P53955	656 aa		2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	ATC1	Q04005	294 aa		2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	RNH1	Q04740	348 aa		2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	RUD3	Q12234	484 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	PST1	Q12355	444 aa		2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	2.7	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	RPL24A	P04449	155 aa	Known RBP	2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MAL32	P38158	584 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	YHL049C	P38722	271 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	TEM1	P38987	245 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	NBP35	P52920	328 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MAL12	P53341	584 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MNT4	P53745	580 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	PEX10	Q05568	337 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	GMC2	Q06201	188 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SLD7	Q08457	257 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	YPL247C	Q12523	523 aa		2.69	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SSK22	P25390	1331 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	COS2	P0CX12	379 aa		2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	COS3	P0CX13	379 aa		2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	RNP1	P32385	249 aa		2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	2.68	□□□□□ -1.98	RIP-Chip
OMA1	YKR087C	AGX1	P43567	385 aa		2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	SWS2	P53937	143 aa		2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	BOP2	Q06150	570 aa		2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	YOR283W	Q12040	230 aa	Known RBP	2.68	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	NTG1	P31378	399 aa		2.67	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	YHR045W	P38775	560 aa		2.67	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	COA1	P40452	197 aa		2.67	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	RRT8	Q08219	342 aa		2.67	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MED4	Q12343	284 aa		2.67	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	GEP5	Q12393	293 aa		2.67	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	STH1	P32597	1359 aa		2.66	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	2.66	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	PRM9	P39551	298 aa		2.66	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	MDM34	P53083	459 aa		2.66	□□□□□ -1.98
OMA1	YKR087C	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	2.65	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	COG3	P40094	801 aa		2.65	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YJL016W	P47072	561 aa		2.65	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	AAH1	P53909	347 aa		2.65	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	RSR1	P13856	272 aa		2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	TCD1	P38756	429 aa		2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	RCY1	P39531	840 aa		2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YJR012C	P47087	207 aa		2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	DAN1	P47178	298 aa		2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	GRX3	Q03835	250 aa		2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YLR173W	Q06247	608 aa		2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	BEM2	P39960	2167 aa	Known RBP	2.64	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	RAD3	P06839	778 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	CWP1	P28319	239 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	KAP114	P53067	1004 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	MAL13	P53338	473 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	COS6	P53344	381 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	TLG1	Q03322	224 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	OST6	Q03723	332 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	EMI1	Q04406	187 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	BTS1	Q12051	335 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YOL107W	Q12239	342 aa		2.63	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	SCO1	P23833	295 aa		2.62	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	DRE2	P36152	348 aa		2.62	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	DDI1	P40087	428 aa		2.62	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	CAB4	P53332	305 aa		2.62	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		2.62	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	PPH21	P23594	369 aa		2.61	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YHL026C	P38740	315 aa		2.61	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	GCN20	P43535	752 aa	Known RBP	2.61	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YPR011C	Q12251	326 aa		2.61	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	YBL008W-A	Q3E821	79 aa		2.61	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	RPB4	P20433	221 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	VPS3	P23643	1011 aa		2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	MRPL49	P40858	161 aa	Predicted RBP	2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	CGR1	P53188	120 aa		2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	SAC3	P46674	1301 aa		2.6	□□□□□ -1.99
OMA1	YKR087C	POX1	P13711	748 aa		2.59	□□□□□ -1.99

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 10.2 ms