RNA–Protein interactions for RNA: YHR004C

NEM1, Transcript of Probable catalytic subunit of Nem1p-Spo7p phosphatase holoenzyme, yeast

Gene NEM1, Length 1,341 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NEM1	YHR004C	RPL23B	P0CX42	137 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	URA10	P30402	227 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PDC2	P32896	925 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SGE1	P33335	543 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YBR241C	P38142	488 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YAP3	P38749	330 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YER121W	P40076	114 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MMS2	P53152	137 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	VHT1	P53241	593 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PEX30	Q06169	523 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	FCY22	Q12119	530 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YDR018C	Q12185	396 aa		3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	URA6	P15700	204 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MGT1	P26188	188 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	FUN26	P31381	517 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	NTF2	P33331	125 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MRPL39	P36533	70 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YCR087C-A	P37263	153 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YMR144W	P40214	342 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YFR057W	P43625	151 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MCM22	P47167	239 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SBH2	P52871	88 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TPN1	P53099	579 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	ALG13	P53178	202 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	CDH1	P53197	566 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	COS1	P53822	381 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YLR460C	P54007	376 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	CDC14	Q00684	551 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SNO1	Q03144	224 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YML018C	Q03730	393 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	GMC1	Q04399	608 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TAZ1	Q06510	381 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPR091C	Q06833	770 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YNG1	Q08465	219 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	GRE1	Q08969	168 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TAF10	Q12030	206 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPL150W	Q12152	901 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RFM1	Q12192	310 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	FRE8	Q12209	686 aa		3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	3.11	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TUS1	Q06412	1307 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SAL1	D6W196	494 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	SPS100	P13130	326 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PPH21	P23594	369 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MEI4	P29467	408 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	LDS1	P31379	325 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	AEP1	P32493	518 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	NUF2	P33895	451 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YKL075C	P36083	450 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	DBP7	P36120	742 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	DER1	P38307	211 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.1	□□□□□ -1.91	not detected
NEM1	YHR004C	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YKE4	P40544	346 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MOB2	P43563	287 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	CTK3	P46963	296 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YGR042W	P53227	271 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	CLD1	P53264	445 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PDR17	P53844	350 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	INM2	Q05533	292 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YPS3	Q12303	508 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MHP1	P43638	1398 aa		3.1	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TRP1	P00912	224 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	PMT2	P31382	759 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MRPL3	P36516	390 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	VMA22	P38784	181 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	HEM14	P40012	539 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	COG3	P40094	801 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	LCB3	P47013	409 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	CPR7	P47103	393 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	OST3	P48439	350 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TRM9	P49957	279 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	NRM1	P53718	249 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	ABF2	Q02486	183 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	VPS60	Q03390	229 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TDA1	Q03533	586 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YML108W	Q03759	105 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MMT2	Q08970	484 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YLR053C	Q12026	108 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	TPO4	Q12256	659 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	MCT1	Q12283	360 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YLR126C	Q12288	251 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	EMP46	Q12396	444 aa		3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	YDL085C-A	Q3E7B7	68 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
NEM1	YHR004C	GCN3	P14741	305 aa		3.08	□□□□□ -1.92

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