RNA–Protein interactions for RNA: YBL037W

APL3, Transcript of Alpha-adaptin, yeast

Gene APL3, Length 3,078 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
APL3	YBL037W	ZRT3	P34240	503 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PET8	P38921	284 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YFL064C	P43540	174 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	AGX1	P43567	385 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	APC1	P53886	1748 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	ASI3	P53983	676 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SLD7	Q08457	257 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YOS9	Q99220	542 aa		0.99	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	STH1	P32597	1359 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	NUP157	P40064	1391 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	AUS1	Q08409	1394 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	OSM1	P21375	501 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RRT12	P25381	491 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PRS1	P32895	427 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SGE1	P33335	543 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	TIP20	P33891	701 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	BMH2	P34730	273 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	MRPL27	P36526	146 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	FZO1	P38297	855 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	DSN1	P40568	576 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	FMP33	P46998	180 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	CGR1	P53188	120 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	TPC1	P53257	314 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	MRS2	Q01926	470 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	VPS60	Q03390	229 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PAM18	Q07914	168 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	BSC6	Q08280	497 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	TRM10	Q12400	293 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YAL067W-A	Q8TGK6	75 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	ADH1	P00330	348 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	NOP1	P15646	327 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	AEP1	P32493	518 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	MRPL39	P36533	70 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SMP1	P38128	452 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RCK1	P38622	512 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YHI9	P38765	294 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	AVT6	P40074	448 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	COX15	P40086	486 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	LIF1	P53150	421 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SWT21	P53873	357 aa	Predicted RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	VBA1	Q04301	562 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	ATG17	Q06410	417 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	TAZ1	Q06510	381 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	MIM1	Q08176	113 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	IES3	Q12345	250 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RAX2	Q12465	1220 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	DYN1	P36022	4092 aa		0.98	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YAL064W-B	O13512	126 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	POF1	P25576	258 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	BIG1	P38813	335 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	UFE1	P41834	346 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	BUD13	P46947	266 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	USE1	P53146	245 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	IGO1	P53897	168 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YMR244W	Q04018	355 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YDR114C	Q04597	100 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RPL4A	P10664	362 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PPA2	P28239	310 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	ERG2	P32352	222 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	FRM2	P37261	193 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	HEK2	P38199	381 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.97	□□□□□ -2.25	not detected
APL3	YBL037W	CUE1	P38428	203 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	BDH1	P39714	382 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	THO1	P40040	218 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	RPL4B	P49626	362 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	EBS1	Q03466	884 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	KRE28	Q04431	385 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YOR114W	Q12219	294 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	FIG2	P25653	1609 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	MRPL25	P23369	157 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	CWP1	P28319	239 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	VPH2	P32341	215 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PRS4	P38063	326 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PRM9	P39551	298 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SEO1	P39709	593 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	VAB2	P40003	282 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SCC4	P40090	624 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	AVT7	P40501	490 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	LSB1	P53281	241 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	MNT4	P53745	580 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	CDC14	Q00684	551 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YPR098C	Q06089	161 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YDR018C	Q12185	396 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	YOR029W	Q12243	111 aa		0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	0.97	□□□□□ -2.25
APL3	YBL037W	PST1	Q12355	444 aa		0.97	□□□□□ -2.25

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