RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540109.5

PTPRD-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene PTPRD, Length 6,210 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-214ENST00000540109 NAF1Q96HR8 494 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC138Q96M89 665 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 MLXIPLQ9NP71 852 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SEPT10Q9P0V9 454 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 APOA1P02647 267 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 VIL1P09327 827 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SNX16P57768 344 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ZBED6P86452 979 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DLGAP5Q15398 846 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TAF12Q16514 161 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 MAN2A1Q16706 1144 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DOK7Q18PE1 504 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 KRT39Q6A163 491 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PDXDC1Q6P996 788 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 GRAMD1CQ8IYS0 662 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 MB21D1Q8N884 522 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 WDR60Q8WVS4 1066 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DPF2Q92785 391 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJC7Q99615 494 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CAPN11Q9UMQ6 739 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PCDHA12Q9UN75 941 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 UTP18Q9Y5J1 556 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ATP8B3O60423 1300 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SPAG7O75391 227 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SREBF1P36956 1147 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 LRRC36Q1X8D7 754 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SLC35G1Q2M3R5 365 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PDZD8Q8NEN9 1154 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CHMP6Q96FZ7 201 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CFAP36Q96G28 342 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ZNF229Q9UJW7 825 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CBFA2T3O75081 653 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PRCPP42785 496 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 AP2B1P63010 937 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 EDRF1Q3B7T1 1238 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 USH1GQ495M9 461 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CENPPQ6IPU0 288 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TTI2Q6NXR4 508 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 APTXQ7Z2E3 356 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 MYOCDQ8IZQ8 938 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SYN2Q92777 582 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PAWRQ96IZ0 340 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PHACTR1Q9C0D0 580 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 VAT1LQ9HCJ6 419 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 INTS13Q9NVM9 706 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 HDAC6Q9UBN7 1215 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 FEM1BQ9UK73 627 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 CAPN15O75808 1086 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TXKP42681 527 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 USP14P54578 494 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PPP2R2AP63151 447 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TMEM139Q8IV31 216 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CCDC105Q8IYK2 499 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 RASGRP4Q8TDF6 673 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 BLZF1Q9H2G9 400 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 KCNMB3Q9NPA1 279 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 SYCE1LA8MT33 242 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 F8W031 263 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TTI1O43156 1089 aa6.43□□□□□ -1.38
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PTPRD-214ENST00000540109 TGFB2P61812 414 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 DNAL1Q4LDG9 190 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 NIM1KQ8IY84 436 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 WDR11Q9BZH6 1224 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TRIM15Q9C019 465 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL25Q9H0H3 589 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 TUFT1Q9NNX1 390 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 CORO1CQ9ULV4 474 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 C15orf41Q9Y2V0 281 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 MYH4Q9Y623 1939 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 KLHL33A6NCF5 533 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 FAM187AA6NFU0 413 aa6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
PTPRD-214ENST00000540109 GYG2O15488 501 aa6.43□□□□□ -1.38
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