RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512193.5

NEK1-208, Transcript of NIMA related kinase 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NEK1, Length 4,430 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK1-208ENST00000512193 ZFP69BQ9UJL9 534 aa8.56□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 XPOTO43592 962 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 C2CD6Q53TS8 623 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SLC10A5Q5PT55 438 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 C4orf33Q8N1A6 199 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 MKNK1Q9BUB5 465 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 KIFC3Q9BVG8 833 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SLC13A1Q9BZW2 595 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 OSGEPQ9NPF4 335 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 POLLQ9UGP5 575 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 RAB21Q9UL25 225 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 FAM237AA0A1B0GTK4 181 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CFAP69A5D8W1 941 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CDH16O75309 829 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 FAM107AO95990 144 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PRLRP16471 622 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CNGA1P29973 690 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 HMGCS2P54868 508 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PSMC6P62333 389 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SPATA21Q7Z572 469 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CRLF3Q8IUI8 442 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 ACER1Q8TDN7 264 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 AGBL1Q96MI9 1066 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CARD9Q9H257 536 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 RPAP3Q9H6T3 665 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 HOXC10Q9NYD6 342 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 MYO3BQ8WXR4 1341 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 LRRC10BA6NIK2 292 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 KRT38O76015 456 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 HAUS5O94927 633 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 BCAR1P56945 870 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CDK17Q00537 523 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 GIT2Q14161 759 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 DUOXA2Q1HG44 320 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 WDR72Q3MJ13 1102 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 FAM102AQ5T9C2 384 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 ATG16L1Q676U5 607 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SPOPLQ6IQ16 392 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CATSPER4Q7RTX7 472 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 BTBD6Q96KE9 485 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SLC4A9Q96Q91 983 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 TUBB6Q9BUF5 446 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 TRABDQ9H4I3 376 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 VCPKMTQ9H867 229 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 FGFR1OP2Q9NVK5 253 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CCDC195A0A1B0GUA6 201 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 TMEM120BA0PK00 339 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 M0QYV0 167 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PIK3R2O00459 728 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PDHA1P08559 390 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 KRT7P08729 469 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 TAL1P17542 331 aaPredicted RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CDH6P55285 790 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 POLE2P56282 527 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 P3H1Q32P28 736 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 AGBL2Q5U5Z8 902 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 BARGINQ6ZT62 677 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 RFX8Q6ZV50 586 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 WDR75Q8IWA0 830 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 ATP11CQ8NB49 1132 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 HDAC11Q96DB2 347 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PNMA5Q96PV4 448 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 OSBPL8Q9BZF1 889 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 KCNH7Q9NS40 1196 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PARVAQ9NVD7 372 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 ASNSD1Q9NWL6 643 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 STRIP2Q9ULQ0 834 aa8.55□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 NR3C2P08235 984 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 GPC3P51654 580 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 ARFIP2P53365 341 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 EVX2Q03828 476 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 STAT4Q14765 748 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 KCNK18Q7Z418 384 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 EXOC8Q8IYI6 725 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SIX6OS1Q8N1H7 587 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 RNF149Q8NC42 400 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 TRAIPQ9BWF2 469 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 TLR10Q9BXR5 811 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 GPRC5CQ9NQ84 441 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SCOCQ9UIL1 159 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 NWD1Q149M9 1564 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 WNT7AO00755 349 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 ITIH2P19823 946 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 SDC4P31431 198 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 CCNA1P78396 465 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 MTMR2Q13614 643 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 PRPSAP1Q14558 356 aa8.54□□□□□ -1.04
NEK1-208ENST00000512193 HIF1AQ16665 826 aa8.54□□□□□ -1.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms