RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504971.1

FBXO38-208, Transcript of F-box protein 38, human

TSL 3

Gene FBXO38, Length 492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC51A	Q86UW1	340 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CCDC83	Q8IWF9	413 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SMARCC2	Q8TAQ2	1214 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	MDM1	Q8TC05	714 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CCT6B	Q92526	530 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SGCD	Q92629	289 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	BRF1	Q92994	677 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	HPS3	Q969F9	1004 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	KLRG1	Q96E93	195 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	EDEM3	Q9BZQ6	932 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF408	Q9H9D4	720 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CYP4F12	Q9HCS2	524 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ALG13	Q9NP73	1137 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	DCP1A	Q9NPI6	582 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SAGE1	Q9NXZ1	904 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	MTRF1L	Q9UGC7	380 aa	Known RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF180	Q9UJW8	692 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CROT	Q9UKG9	612 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CNPY2	Q9Y2B0	182 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ZNF646	O15015	1829 aa	Predicted RBP	7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PSME4	Q14997	1843 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	NID2	Q14112	1375 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ROBO3	Q96MS0	1386 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	MYH2	Q9UKX2	1941 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	LAMB1	P07942	1786 aa		7.31	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	IQANK1	A0A1B0GTG1	560 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	VSTM5	A8MXK1	200 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PDLIM1	O00151	329 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TREH	O43280	583 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	STX6	O43752	255 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	OPA1	O60313	960 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TGDS	O95455	350 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	DPEP1	P16444	411 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SERPINB3	P29508	390 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PDIA3	P30101	505 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	HOXC12	P31275	282 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	STAT3	P40763	770 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ARHGAP4	P98171	946 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	UBXN1	Q04323	297 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CACNB2	Q08289	660 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	LAMB3	Q13751	1172 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	DPYS	Q14117	519 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SART3	Q15020	963 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	IKBIP	Q70UQ0	350 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	KDELC2	Q7Z4H8	507 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PPFIBP1	Q86W92	1011 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	FAM26E	Q8N5C1	309 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SMYD1	Q8NB12	490 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PCSK9	Q8NBP7	692 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PPP1R14C	Q8TAE6	165 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	NOC3L	Q8WTT2	800 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SDR42E1	Q8WUS8	393 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	RABGGTA	Q92696	567 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ESR2	Q92731	530 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNN1	Q92952	543 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TTC17	Q96AE7	1141 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	CHFR	Q96EP1	664 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	DTNBP1	Q96EV8	351 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	DNAJC7	Q99615	494 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	KANSL2	Q9H9L4	492 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PARVG	Q9HBI0	331 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	AATF	Q9NY61	560 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PIM2	Q9P1W9	311 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ZC3H7B	Q9UGR2	993 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PFDN2	Q9UHV9	154 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TEKT2	Q9UIF3	430 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX52	Q9Y2R4	599 aa	Known RBP eCLIP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SLC4A7	Q9Y6M7	1214 aa		7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	NEDD4	P46934	1319 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	MYO3B	Q8WXR4	1341 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	FOCAD	Q5VW36	1801 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971		A0A1B0GTH6	734 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L3	A6NCW0	530 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	USP17L4	A6NCW7	530 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971		B4E1Z4	1266 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	TMEM232	C9JQI7	657 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971		F5H423	210 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	PI4K2B	G5E9Z4	385 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	EBAG9	O00559	213 aa		7.29	□□□□□ -1.24
FBXO38-208	ENST00000504971	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24

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