RNA–Protein interactions for RNA: YOR115C

TRS33, Transcript of Core component of transport protein particle (TRAPP) complexes I-III, yeast

Gene TRS33, Length 807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
TRS33	YOR115C	YCR016W	P25617	290 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	YOR062C	P36025	268 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	PEX32	P38292	413 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	WSC4	P38739	605 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	YHR122W	P38829	231 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	PHM8	P40025	321 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	PMT5	P52867	743 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	YIP4	P53093	235 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	SAY1	P53324	424 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	DML1	Q03652	475 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	ASR1	Q06834	288 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	SYO1	Q07395	620 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	YNG1	Q08465	219 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	INP53	Q12271	1107 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	RTR2	Q12378	196 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	FRE6	Q12473	712 aa		4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	DET1	Q99288	334 aa	Known RBP	4.41	□□□□□ -1.7
TRS33	YOR115C	YLR302C	O13544	120 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	STE12	P13574	688 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SEN2	P16658	377 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YPK2	P18961	677 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	HCM1	P25364	564 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PBN1	P25580	416 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	DOA4	P32571	926 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PAU2	P32612	120 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	TIM12	P32830	109 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	ECT1	P33412	323 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	MTH1	P35198	433 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YKL063C	P35725	167 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	MAL32	P38158	584 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	TRR2	P38816	342 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	CHS7	P38843	316 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	VPS52	P39904	641 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	RTT105	P40063	208 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SLZ1	P40167	298 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PKP1	P40530	394 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	CAT5	P41735	233 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PMT6	P42934	759 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	APS3	P47064	194 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	MAL12	P53341	584 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	AIM36	Q03798	255 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	RRN11	Q04712	507 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	STP3	Q05937	343 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YPL272C	Q08984	517 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	ATG31	Q12421	196 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	APC2	Q12440	853 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		4.4	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	AAC1	P04710	309 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	RPL20A	P0CX23	172 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	RPL20B	P0CX24	172 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	BAR1	P12630	587 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	CKA1	P15790	372 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PTP1	P25044	335 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	MXR2	P25566	168 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	VPS17	P32913	551 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SRX1	P36077	127 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	VPS51	P36116	164 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	MRPL3	P36516	390 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PHO90	P39535	881 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	ELO1	P39540	310 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	PRP39	P39682	629 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	UTP25	P40498	721 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	ICE2	P40499	491 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	TIR3	P40552	269 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	NAS2	P40555	220 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	RPE1	P46969	238 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SFH5	P47008	294 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SNX4	P47057	423 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	MDE1	P47095	244 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YGL235W	P53071	178 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	FMP48	P53233	369 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	DID2	P69771	204 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SMA2	Q04658	369 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	COX20	Q04935	205 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YLR283W	Q05867	314 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SNT309	Q06091	175 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YPR091C	Q06833	770 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YOL073C	Q08232	322 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	HRT1	Q08273	121 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YOR365C	Q08844	703 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	SWT1	Q12104	458 aa		4.39	□□□□□ -1.71
TRS33	YOR115C	YOR214C	Q12282	236 aa		4.39	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms