RNA–Protein interactions for RNA: YOR033C

EXO1, Transcript of 5'-3' exonuclease and flap-endonuclease, yeast

Gene EXO1, Length 2,109 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EXO1	YOR033C	PEX34	P25584	144 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PRP45	P28004	379 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MSK1	P32048	576 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	EMP24	P32803	203 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PHO89	P38361	574 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MUP3	P38734	546 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MOB1	P40484	314 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	IKS1	P47042	667 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SCW11	P53189	542 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GTR2	P53290	341 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GPI15	P53961	229 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SMX3	P54999	86 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DAD3	P69850	94 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PLB2	Q03674	706 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PRP11	Q07350	266 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	UPC2	Q12151	913 aa		4.75	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YIL177C	P40434	1758 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YJL225C	P40889	1758 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPS4A	P0CX35	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RPS4B	P0CX36	261 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	EST1	P17214	699 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ART10	P18634	518 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	NPR1	P22211	790 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PBN1	P25580	416 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YCR102C	P25608	368 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	BCS1	P32839	456 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PTK1	P36002	662 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TFA2	P36145	328 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	FLX1	P40464	311 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YCH1	P42937	148 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YFL040W	P43562	540 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CHA4	P43634	648 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YGL138C	P53122	345 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RHO4	Q00246	291 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SKO1	Q02100	647 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YML018C	Q03730	393 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TRM12	Q04235	462 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SDH7	Q04401	133 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	NOC4	Q06512	552 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YOL131W	Q08270	108 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YOL159C	Q08300	171 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	NAT5	Q08689	176 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	NBP2	Q12163	236 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PRR2	Q12310	699 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YOL159C-A	Q3E769	90 aa		4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TY1B-NL2	Q99337	1749 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	GDH1	P07262	454 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ALG7	P07286	448 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YCP4	P25349	247 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SEC17	P32602	292 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	UTR2	P32623	467 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YHR127W	P38833	243 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YIL152W	P40455	235 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ZAP1	P47043	880 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	OST3	P48439	350 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RIB4	P50861	169 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YLR456W	Q06199	204 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TPO3	Q06451	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PAM18	Q07914	168 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MMT2	Q08970	484 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CYT1	P07143	309 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PEP4	P07267	405 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DAL82	P21705	255 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	LSB5	P25369	354 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YCR061W	P25639	631 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YEF1	P32622	495 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	LDH1	P38139	375 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	CUE1	P38428	203 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SKN7	P38889	622 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ACA1	P39970	489 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	IME4	P41833	600 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ATG18	P43601	500 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MIC26	P50087	233 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	DIA3	P52290	468 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YGR053C	P53234	283 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	SPR6	Q01684	191 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YMR160W	Q03823	816 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YMR130W	Q04223	302 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MRPL1	Q04599	285 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ECM22	Q05958	814 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	ANT1	Q06497	328 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	RDR1	Q08904	546 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	HRP1	Q99383	534 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	TIM9	O74700	87 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	YPR170W-B	P0C5R9	85 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	EPT1	P22140	391 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	PRE8	P23639	250 aa		4.72	□□□□□ -1.65
EXO1	YOR033C	MRP20	P32387	263 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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