RNA–Protein interactions for RNA: YNL247W

YNL247W, Transcript of Cysteinyl-tRNA synthetase, yeast

Gene YNL247W, Length 2,304 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YNL247W	YNL247W	SEC10	Q06245	871 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	FOL3	Q12676	427 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	TRS65	P32893	560 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	YBR062C	P38239	180 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	VAB2	P40003	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	TPC1	P53257	314 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	FAR10	Q06001	478 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	DTD1	Q07648	150 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	TFC7	Q12415	435 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	RPO31	P04051	1460 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	PDR15	Q04182	1529 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	RPH1	P39956	796 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	MOB2	P43563	287 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	YPR098C	Q06089	161 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	LOA1	Q06508	300 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	ICT1	Q12385	394 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	CHL4	P38907	458 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	HEM14	P40012	539 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	YER121W	P40076	114 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	MAM33	P40513	266 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	VAC7	P53950	1165 aa		4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	RRP17	Q04031	235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	RRS1	Q08746	203 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	PEP1	P32319	1579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	FES1	P38260	290 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	MDV1	P47025	714 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	NUP57	P48837	541 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	SLX9	P53251	210 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	DIG1	Q03063	452 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	SCS7	Q03529	384 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	ERP1	Q05359	219 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	YAL064W-B	O13512	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	TRP1	P00912	224 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	RPL15A	P05748	204 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	AEP1	P32493	518 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	NCA3	P46955	337 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	TRM9	P49957	279 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	MCT1	Q12283	360 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	SIR4	P11978	1358 aa		4.91	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	MRPL20	P22354	195 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	FZO1	P38297	855 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	GOS1	P38736	223 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	THI7	Q05998	598 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	COQ10	Q08058	207 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	MMT2	Q08970	484 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	GEA1	P47102	1408 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
YNL247W	YNL247W	BCY1	P07278	416 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	IFM1	P25038	676 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	TMA22	P47089	198 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	SCS3	P53012	380 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	SHY1	P53266	389 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	YML018C	Q03730	393 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	ARR2	Q06597	130 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	SNA4	Q07549	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	YCF1	P39109	1515 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	DNF1	P32660	1571 aa		4.9	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	TY1B-DR3	Q99231	1755 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	SPT3	P06844	337 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	CPR1	P14832	162 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	CBS2	P14905	389 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	YLR152C	P54072	576 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	VPS60	Q03390	229 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	GAS2	Q06135	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	HEM25	Q07534	307 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	MIM1	Q08176	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	ATP16	Q12165	160 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	MHP1	P43638	1398 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	AME1	P38313	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	HAC1	P41546	238 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	SNZ3	P43545	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	SNZ2	P53824	298 aa		4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	RHO3	Q00245	231 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	MDS3	P53094	1487 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	TSC11	P40061	1430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	URA6	P15700	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	PHO80	P20052	293 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	GPX1	P36014	167 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	RFT1	P38206	574 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	KRE29	P40026	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	YIL152W	P40455	235 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	YKE4	P40544	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	TY2B-LR1	P0C2J3	1770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	TY2B-F	P0CX63	1770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	TY2B-GR2	P0CX64	1770 aa		4.88	□□□□□ -1.63
YNL247W	YNL247W	TY2B-C	P25384	1770 aa		4.88	□□□□□ -1.63

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 107 ms