RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	RPL18A	P0CX49	186 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	RPL18B	P0CX50	186 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	CCA1	P21269	546 aa		0.74	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	POX1	P13711	748 aa		0.73	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	PPH21	P23594	369 aa		0.73	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	YKL162C	P36052	402 aa		0.73	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	VTC1	P40046	129 aa	RIP-Chip data	0.73	□□□□□ -2.29	not detected
Q0144	Q0144	DPP1	Q05521	289 aa		0.73	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	GEP5	Q12393	293 aa		0.73	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	YPR1	Q12458	312 aa		0.73	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	0.72	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	YOR114W	Q12219	294 aa		0.72	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	MDH2	P22133	377 aa		0.71	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	BMT5	P40493	336 aa		0.71	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	PBP4	Q07362	185 aa	Known RBP	0.71	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	RNR2	P09938	399 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	RNP1	P32385	249 aa		0.7	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	SUA5	P32579	426 aa		0.7	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	0.7	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	YER188C-A	P0C0V2	99 aa		0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	PEX4	P29340	183 aa		0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	YBR219C	P38317	127 aa		0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	TEM1	P38987	245 aa		0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	JEM1	P40358	645 aa		0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	MDM34	P53083	459 aa		0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	FRE6	Q12473	712 aa		0.69	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	NIF3	P53081	288 aa		0.68	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	YMR209C	Q03648	457 aa		0.68	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	VMA2	P16140	517 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	RPS0A	P32905	252 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	HMT1	P38074	348 aa		0.67	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	CUE3	P53137	624 aa	Known RBP	0.67	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	APC9	Q12107	265 aa		0.67	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	YMR316C-A	I2HB70	103 aa		0.66	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	RXT2	P38255	430 aa		0.66	□□□□□ -2.3
Q0144	Q0144	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	0.65	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	PRM10	P42946	383 aa		0.65	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	CSI2	Q08054	341 aa		0.64	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	SHC1	P39000	512 aa		0.63	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	AGX1	P43567	385 aa		0.63	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	0.63	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	VPS60	Q03390	229 aa		0.63	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	PST1	Q12355	444 aa		0.63	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	MAL32	P38158	584 aa		0.62	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	DOG1	P38774	246 aa		0.62	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	LIN1	P38852	340 aa	Predicted RBP	0.62	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	YJL028W	P47062	111 aa		0.62	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	ERG25	P53045	309 aa		0.62	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	MAL12	P53341	584 aa		0.62	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	DSF1	P0CX08	502 aa		0.61	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	YNR073C	P0CX09	502 aa		0.61	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	MRPS8	Q03799	155 aa		0.61	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	TAF9	Q05027	157 aa		0.61	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	0.6	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.6	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	AVT2	P39981	480 aa		0.6	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	CYT2	Q00873	224 aa		0.6	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	COS2	P0CX12	379 aa		0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	COS3	P0CX13	379 aa		0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	GAL3	P13045	520 aa		0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	YKL063C	P35725	167 aa		0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	RPC37	P36121	282 aa		0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	SDC1	Q03323	175 aa		0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	BOP2	Q06150	570 aa		0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.59	□□□□□ -2.31	not detected
Q0144	Q0144	RIO1	Q12196	484 aa	Known RBP	0.59	□□□□□ -2.31
Q0144	Q0144	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	0.58	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	OST2	P46964	130 aa		0.58	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	ASI3	P53983	676 aa		0.58	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	RSM10	Q03201	203 aa		0.58	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	YHR022C	P38763	256 aa		0.57	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	KDX1	P36005	433 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	LAS1	P36146	502 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	NPT1	P39683	429 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	RPL13B	P40212	199 aa	Known RBP	0.56	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	LOA1	Q06508	300 aa		0.56	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	RPL13A	Q12690	199 aa	Predicted RBP	0.56	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	VAR1	P02381	398 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	SIF2	P38262	535 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	PHO88	P38264	188 aa	Predicted RBP	0.55	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	YPL077C	Q02831	240 aa		0.55	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	FET3	P38993	636 aa		0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	YIA6	P40556	373 aa		0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	COX16	P47081	118 aa		0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	BUD25	P85052	153 aa		0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	PEX10	Q05568	337 aa		0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	YLR162W	Q06235	118 aa		0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	ATO3	Q12359	275 aa		0.54	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	DDI2	P0CH63	225 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	DDI3	P0CH64	225 aa		0.53	□□□□□ -2.32
Q0144	Q0144	SWI3	P32591	825 aa		0.53	□□□□□ -2.32

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 108.9 ms