RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572445.1

PRPF8-204, Transcript of pre-mRNA processing factor 8, humanhuman

TSL 2

Gene PRPF8, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF8-204ENST00000572445 ZDBF2Q9HCK1 2354 aa7.15□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 M0QZ92 97 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 DDAH1O94760 285 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 KIF4AO95239 1232 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GJB6O95452 261 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PDGFRBP09619 1106 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GNAT1P11488 350 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 KCNA2P16389 499 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 POU3F3P20264 500 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 KIF5BP33176 963 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 NAPAP54920 295 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MRPS6P82932 125 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 CLCQ05315 142 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 HYAL1Q12794 435 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 TROAPQ12815 778 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MTMR1Q13613 665 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 FRMPD4Q14CM0 1322 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 WDR44Q5JSH3 913 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 LLGL2Q6P1M3 1020 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 SPATC1Q76KD6 591 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PGBD3Q8N328 593 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 RNF169Q8NCN4 708 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 LINC01599Q8WXQ3 324 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 HPS1Q92902 700 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 USP26Q9BXU7 913 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 CRISPLD1Q9H336 500 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 AGO3Q9H9G7 860 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 BRMS1Q9HCU9 246 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 HCN2Q9UL51 889 aa7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 H3BNC9 293 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MEIS2O14770 477 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 SGSM2O43147 1006 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 DCXO43602 365 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 RARAP10276 462 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 INSRRP14616 1297 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 CPA1P15085 419 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 ITGB5P18084 799 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PBX3P40426 434 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 NRIP1P48552 1158 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 RPS26P62854 115 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 ZP2Q05996 745 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MTERF2Q49AM1 385 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 FBXO47Q5MNV8 452 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PLPP4Q5VZY2 271 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GK5Q6ZS86 529 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 RSPH3Q86UC2 560 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 CYP2W1Q8TAV3 490 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GATAD2BQ8WXI9 593 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 TOP1MTQ969P6 601 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 SCLT1Q96NL6 688 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 IER2Q9BTL4 223 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 AZI2Q9H6S1 392 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PSTPIP2Q9H939 334 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GABBR1Q9UBS5 961 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 CDH22Q9UJ99 828 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PCDHA6Q9UN73 950 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 SLC12A7Q9Y666 1083 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 KMT2EQ8IZD2 1858 aa7.13□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MYO10Q9HD67 2058 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 NRCAMQ92823 1304 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GOLGA8AA7E2F4 631 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 TBKBP1A7MCY6 615 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GOLGA8BA8MQT2 603 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PI4K2BG5E9Z4 385 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 SLC27A2O14975 620 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PER2O15055 1255 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 ITGB1P05556 798 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 THBS1P07996 1170 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 ARP10275 920 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 TGFB3P10600 412 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 FGFR1P11362 822 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 DNAJB1P25685 340 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 HOXC8P31273 242 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 ICAM3P32942 547 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 ADCY7P51828 1080 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 GHRHRQ02643 423 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MGAT3Q09327 533 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MPP2Q14168 576 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 PLCB4Q15147 1175 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 LONRF3Q496Y0 759 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 C6orf118Q5T5N4 469 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 SAMD5Q5TGI4 173 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.12□□□□□ -1.27
PRPF8-204ENST00000572445 MRM1Q6IN84 353 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms