RNA–Protein interactions for RNA: YOL089C

HAL9, Transcript of Putative transcription factor containing a zinc finger, yeast

Gene HAL9, Length 3,093 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HAL9	YOL089C	DAL81	P21657	970 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YSR3	P23501	404 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	POT1	P27796	417 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.44	□□□□□ -2.34	not detected
HAL9	YOL089C	ACB1	P31787	87 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TIP20	P33891	701 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YBR062C	P38239	180 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CAJ1	P39101	391 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SSU72	P53538	206 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	DAL5	P15365	543 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MAL32	P38158	584 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PEX31	P53203	462 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MAL12	P53341	584 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YNR066C	P53752	436 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YOL019W	Q08157	551 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PRR2	Q12310	699 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	BUD3	P25558	1636 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	GPI12	P23797	304 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YEL043W	P32618	956 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	COT1	P32798	439 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	AVT6	P40074	448 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	COS4	P43542	379 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PMT4	P46971	762 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	NIF3	P53081	288 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	BIO4	P53630	237 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MIM1	Q08176	113 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TY3A-G	Q12173	290 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YDR018C	Q12185	396 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PSY3	Q12318	242 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TY3A-I	Q99219	290 aa		0.44	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MBA1	P38300	278 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	VOA1	P53262	265 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CPD1	P53314	239 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SMC4	Q12267	1418 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CDC42	P19073	191 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	BUD2	P33314	1104 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YKL162C	P36052	402 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MED8	P38304	223 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YHR035W	P38769	630 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YFR054C	P43622	192 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SDS23	P53172	527 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YDR209C	Q03480	137 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SPO77	Q06134	477 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	CTR3	Q06686	241 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	APC9	Q12107	265 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PER33	Q12144	273 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YDR262W	Q12331	272 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	BBP1	Q12365	385 aa		0.43	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RAD10	P06838	210 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	RPB9	P27999	122 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	FRM2	P37261	193 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	OSW5	P40219	148 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YIL177C	P40434	1758 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YJL225C	P40889	1758 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	COX16	P47081	118 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	EFM3	P47163	339 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TIM21	P53220	239 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YDR222W	Q04925	415 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	GPN3	Q06543	272 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YOR292C	Q08743	309 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TRM10	Q12400	293 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YHR086W-A	Q3E746	53 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	NUP192	P47054	1683 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	IFM1	P25038	676 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	DCC1	P25559	380 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	ALK2	P32789	676 aa	Predicted RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	COY1	P34237	679 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YKL063C	P35725	167 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TAD2	P47058	250 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SLM2	P53955	656 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SCS7	Q03529	384 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	PEX30	Q06169	523 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	TAZ1	Q06510	381 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	NOP6	Q07623	225 aa	Known RBP	0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SIA1	Q12212	622 aa		0.42	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YCR025C	P25352	136 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	ERG2	P32352	222 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YKL187C	P34231	750 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MRPL3	P36516	390 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	SOP4	P39543	234 aa	Predicted RBP	0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	EMC2	P47133	292 aa	Known RBP	0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	MAL13	P53338	473 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	YMR166C	Q03829	368 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	GCN2	P15442	1659 aa		0.41	□□□□□ -2.34
HAL9	YOL089C	DNF3	Q12674	1656 aa		0.41	□□□□□ -2.34

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