RNA–Protein interactions for RNA: YOL054W

PSH1, Transcript of E3 ubiquitin ligase targeting centromere-binding protein Cse4p, yeast

Gene PSH1, Length 1,221 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PSH1	YOL054W	ARX1	Q03862	593 aa	Known RBP	5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	COX20	Q04935	205 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RSF1	Q05043	376 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	BOP2	Q06150	570 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ARV1	Q06541	321 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	IPK1	Q06667	281 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	DCI1	Q08558	271 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FRE3	Q08905	711 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FAB1	P34756	2278 aa		5.17	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RPL7A	P05737	244 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	DSF1	P0CX08	502 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YNR073C	P0CX09	502 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	OAR1	P35731	278 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SHE2	P36068	246 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.16	□□□□□ -1.58	not detected
PSH1	YOL054W	TUL1	P36096	758 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SRO77	P38163	1010 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PTI1	P39927	425 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YFR020W	P43600	232 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	MSY1	P48527	492 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PYK2	P52489	506 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	COS10	P52924	374 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	ROG1	P53118	685 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FLC3	P53121	802 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PRM15	Q03262	622 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FEX1	Q08913	375 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	FEX2	Q08991	375 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	DAP1	Q12091	152 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YDL109C	Q12103	647 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	RPL7B	Q12213	244 aa	Known RBP	5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	PSF1	Q12488	208 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YHR213W-A	Q8TGT4	77 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PSH1	YOL054W	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CBS1	P14066	229 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CKA1	P15790	372 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ERD2	P18414	219 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	APN1	P22936	367 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	EXG1	P23776	448 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ANR2	P36090	516 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPS20	P38701	121 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ALP1	P38971	573 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	AIM2	P39721	246 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SWM2	P40342	146 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PKP1	P40530	394 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CIN1	P40987	1014 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YFL015C	P43578	164 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MDE1	P47095	244 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	BAT2	P47176	376 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	GLO1	P50107	326 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	VEL1	P53058	206 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PAU12	P53343	120 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MTQ1	P53944	314 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPL6A	Q02326	176 aa	Known RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YPL068C	Q02749	293 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RSM28	Q03430	361 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SSK1	Q07084	712 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	REX4	Q08237	289 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YPR022C	Q12139	1133 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YOL107W	Q12239	342 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ATP14	Q12349	124 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	FRE6	Q12473	712 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MSB2	P32334	1306 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	BAR1	P12630	587 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPL3	P14126	387 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	UTR1	P21373	530 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	VMA16	P23968	213 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ACB1	P31787	87 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	DOA4	P32571	926 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	AUR1	P36107	401 aa	Predicted RBP	5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	MOH1	P38191	138 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	GEP4	P38812	185 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CHL4	P38907	458 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	BNA6	P43619	295 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RAD17	P48581	401 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPS12	P48589	143 aa	Known RBP	5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PMT5	P52867	743 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YNR061C	P53747	219 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	SCS7	Q03529	384 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	PDR8	Q06149	701 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ATG41	Q12048	136 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	AEP3	Q12089	606 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	TPO4	Q12256	659 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	APC2	Q12440	853 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CET1	O13297	549 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	ARG80	P07249	177 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	YOL162W	P0CF19	215 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPS18A	P0CX55	146 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	RPS18B	P0CX56	146 aa	Predicted RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	HOM2	P13663	365 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CDC23	P16522	626 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	5.13	□□□□□ -1.59
PSH1	YOL054W	FUN26	P31381	517 aa		5.13	□□□□□ -1.59

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 14.9 ms