RNA–Protein interactions for RNA: YLL013C

PUF3, Transcript of Protein of the mitochondrial outer surface, yeast

Gene PUF3, Length 2,640 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
PUF3	YLL013C	LAP3	Q01532	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.97	□□□□□ -1.61	not detected
PUF3	YLL013C	YPL077C	Q02831	240 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	DAL80	P26343	269 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	APL3	P38065	1025 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	ECM8	P38246	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YIL012W	P40551	113 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	MDJ2	P42834	146 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	ASI3	P53983	676 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YLR040C	Q07988	224 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	MCH4	Q08268	501 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	PCL9	Q12477	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YHL044W	P38727	235 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YER121W	P40076	114 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	BUR6	P40096	142 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	QDR1	P40475	563 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	VMA10	P48836	114 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	VOA1	P53262	265 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	SED1	Q01589	338 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YTH1	Q06102	208 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	YPR097W	Q06839	1073 aa		4.96	□□□□□ -1.61
PUF3	YLL013C	URA2	P07259	2214 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	KIN28	P06242	306 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RPS23B	P0CX30	145 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SPT10	P35208	640 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YIL029C	P40538	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	LOH1	P47055	219 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	AIM6	Q07716	390 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	TAF3	Q12297	353 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RAS1	P01119	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SCEI	P03882	235 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FAR1	P21268	830 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PCL1	P24867	279 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	BOS1	P25385	244 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SLS1	P42900	643 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RET2	P43621	546 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	BUD17	P53727	317 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YMR099C	Q03161	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MRX8	Q05473	314 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YOR238W	Q08634	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	DSF1	P0CX08	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YNR073C	P0CX09	502 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SSE2	P32590	693 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	CLG1	P35190	452 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YHR035W	P38769	630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	ECM1	P39715	212 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	AIM36	Q03798	255 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FIN1	Q03898	291 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YPK3	P38070	525 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	TIR3	P40552	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	EGT2	P42835	1041 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RSM23	Q01163	450 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YLR345W	Q06137	509 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	COX5B	P00425	151 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	DBF2	P22204	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FPS1	P23900	669 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	GLC7	P32598	312 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MNS1	P32906	549 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	DTR1	P38125	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	FLX1	P40464	311 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SDP1	P40479	209 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	AAD14	P42884	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YJL016W	P47072	561 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SBH2	P52871	88 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YIP5	P53108	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PRP21	P32524	280 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SUR1	P33300	382 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	SAY1	P53324	424 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YMR279C	Q03263	540 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YDR391C	Q04170	232 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RRP15	Q06511	250 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MEU1	Q07938	337 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
PUF3	YLL013C	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YPL119C-A	Q3E751	87 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MDM31	P38880	579 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	ARP10	Q04549	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	BRE4	Q07660	1125 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	GAT3	Q07928	141 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.93	□□□□□ -1.62	not detected
PUF3	YLL013C	FSH3	Q99369	266 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	RPL6B	P05739	176 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	NAM2	P11325	894 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	MRT4	P33201	236 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YKR015C	P36111	568 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	IPT1	P38954	527 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	GRX5	Q02784	150 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	GPI17	Q04080	534 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PUF3	YLL013C	YMR087W	Q04299	284 aa		4.93	□□□□□ -1.62

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