RNA–Protein interactions for RNA: YJL033W

HCA4, Transcript of DEAD box RNA helicase, yeast

Gene HCA4, Length 2,313 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
HCA4	YJL033W	HPT1	Q04178	221 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SEN15	Q04675	128 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SNO4	Q04902	237 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	HSP33	Q08914	237 aa	Known RBP	3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	HSP32	Q08992	237 aa		3.54	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MSF1	P08425	469 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MRPL44	P19956	98 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	FET3	P38993	636 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	HPA3	P39979	161 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SLZ1	P40167	298 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YIL152W	P40455	235 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PKP1	P40530	394 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YJL218W	P40892	196 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ATG18	P43601	500 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	TOM22	P49334	152 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MKC7	P53379	596 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SLM2	P53955	656 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	NUP116	Q02630	1113 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	NUP53	Q03790	475 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	AKR2	Q12013	749 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SPC3	Q12133	184 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PKH2	Q12236	1081 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MDY2	Q12285	212 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SFM1	Q12314	213 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YDL199C	Q12407	687 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ECM29	P38737	1868 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	LAA1	P39526	2014 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	FUM1	P08417	488 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RPL42A	P0CX27	106 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RPL42B	P0CX28	106 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PET9	P18239	318 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MSN2	P33748	704 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MAL32	P38158	584 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PEX32	P38292	413 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	ARP1	P38696	384 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	EFM1	P38732	585 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YHR054C	P38780	354 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	AFG3	P39925	761 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PGD1	P40356	397 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	AIM22	P47051	409 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	PAC10	P48363	199 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	STR3	P53101	465 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	SWC4	P53201	476 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	MAL12	P53341	584 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	IZH1	Q03419	316 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	GAS3	Q03655	524 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YDR131C	Q03899	556 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	RTN2	Q12443	393 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.53	□□□□□ -1.84
HCA4	YJL033W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	REV1	P12689	985 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	MAG1	P22134	296 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	PHO91	P27514	894 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	SEF1	P34228	1148 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	SNU114	P36048	1008 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	SOL2	P37262	315 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	PAN6	P40459	309 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	CIN5	P40917	295 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	UFE1	P41834	346 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	TIS11	P47977	285 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	ART5	P53244	586 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	ODC1	Q03028	310 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	GOT1	Q03554	138 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	GAS2	Q06135	555 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	RRP40	Q08285	240 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	AGC1	Q12482	902 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	MHF2	Q3E829	80 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	SRN2	Q99176	213 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	UTR1	P21373	530 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	DCC1	P25559	380 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	IDH1	P28834	360 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.52	□□□□□ -1.85	not detected
HCA4	YJL033W	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	ALY1	P36117	915 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	AVT5	P38176	459 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	RGI2	P40188	164 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	GLR1	P41921	483 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	YGR201C	P42936	225 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	MRX5	P47007	382 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	MPC1	P53157	130 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	YNL181W	P53878	407 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	YMR178W	Q03219	274 aa	Known RBP	3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	YMD8	Q03697	442 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	SMA2	Q04658	369 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	GPM2	Q12008	311 aa		3.52	□□□□□ -1.85
HCA4	YJL033W	EAF3	Q12432	401 aa		3.52	□□□□□ -1.85

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