RNA–Protein interactions for RNA: YHR087W

RTC3, Transcript of Protein of unknown function involved in RNA metabolism, yeast

Gene RTC3, Length 336 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RTC3	YHR087W	PEX30	Q06169	523 aa		13.6	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	CUP9	P41817	306 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	DIE2	P50076	525 aa		13.59	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	HAA1	Q12753	694 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
RTC3	YHR087W	SOD2	P00447	233 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SPS2	P08459	502 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	YCR102C	P25608	368 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ERG9	P29704	444 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	PRE4	P30657	266 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ATS1	P31386	333 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	THI4	P32318	326 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SDS24	P38314	527 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ECL1	P48235	211 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SCS7	Q03529	384 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	BDS1	Q08347	646 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ENV7	Q12003	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SCO1	P23833	295 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	BOL3	P39724	118 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ORM1	P53224	222 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ASR1	Q06834	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	OPI3	P05375	206 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	RPL17A	P05740	184 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ATG22	P25568	528 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ERG24	P32462	438 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SEF1	P34228	1148 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	UTP30	P36144	274 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	PKP1	P40530	394 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SLS1	P42900	643 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	RPL17B	P46990	184 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	RTC5	Q12108	567 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	MTR10	Q99189	972 aa		13.56	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	MRPL3	P36516	390 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	NAS2	P40555	220 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	YJR120W	P47157	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	MTM1	P53320	366 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	BNA7	Q04066	261 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	COX20	Q04935	205 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	MRX8	Q05473	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	KEI1	Q06346	221 aa		13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	YPR147C	Q06522	304 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	FAS1	P07149	2051 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ADK1	P07170	222 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	DIT1	P21623	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	TAT1	P38085	619 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	ORM2	Q06144	216 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	INP53	Q12271	1107 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	YOR032W-A	Q8TGS1	66 aa		13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	CYR1	P08678	2026 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	MATALPHA1	P0CY06	175 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	HMLALPHA1	P0CY07	175 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	MNN5	P46982	586 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	PMT3	P47190	753 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	TRS23	Q03784	219 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	MIM1	Q08176	113 aa		13.53	□□□□□ -0.24
RTC3	YHR087W	YPT1	P01123	206 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	SPT10	P35208	640 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	VMA22	P38784	181 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CHS7	P38843	316 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	OCA1	P50946	238 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	BRR6	P53062	197 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CGI121	Q03705	181 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	NMA1	Q06178	401 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YOR376W	Q08900	122 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	GRE1	Q08969	168 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	AKR2	Q12013	749 aa		13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	LYS21	Q12122	440 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	IPP1	P00817	287 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	NHP6B	P11633	99 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CNE1	P27825	502 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	AIM25	P47140	327 aa		13.51	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	PUP1	P25043	261 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	LDB16	P25587	256 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	PPA2	P28239	310 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	RNP1	P32385	249 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YER010C	P40011	234 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	SYS1	P41544	203 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	PEX25	Q02969	394 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YPL039W	Q03080	316 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YOL024W	Q08172	172 aa		13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	13.5	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MSW1	P04803	379 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	PET122	P10355	254 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CDC23	P16522	626 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	CPR2	P23285	205 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	PGU1	P47180	361 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	MTL1	P53214	551 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	VHT1	P53241	593 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YGR126W	P53274	230 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	YLR152C	P54072	576 aa		13.49	□□□□□ -0.25
RTC3	YHR087W	NIP7	Q08962	181 aa	Known RBP	13.49	□□□□□ -0.25

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