RNA–Protein interactions for RNA: YER143W

DDI1, Transcript of DNA damage-inducible v-SNARE binding protein, yeastyeast

Gene DDI1, Length 1,287 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
DDI1YER143W PMT5P52867 743 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PBP1P53297 722 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W HOL1P53389 586 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YPL039WQ03080 316 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RSM24Q03976 319 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W BNA7Q04066 261 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MIX14Q04341 121 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W VBA4Q04602 768 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W HMS1Q12398 434 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YLR099W-AQ3E798 87 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MTR10Q99189 972 aa7.91□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YAL064W-BO13512 126 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W QCR7P00128 127 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W CPR2P23285 205 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W ATS1P31386 333 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PDR3P33200 976 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W COS9P36034 407 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W CCZ1P38273 704 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PEX32P38292 413 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W PRY1P47032 299 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MSY1P48527 492 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W IMD3P50095 523 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SDC1Q03323 175 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RSM28Q03430 361 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W MIM1Q08176 113 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YRM1Q12340 786 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W YPR1Q12458 312 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W SUS1Q6WNK7 96 aa7.9□□□□□ -1.14
DDI1YER143W RPS13P05756 151 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W STE50P25344 346 aa7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SPT14P32363 452 aa7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SHO1P40073 367 aa7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YJL055WP47044 245 aa7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W CIK1Q01649 594 aa7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SSY1Q03770 852 aa7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W NIP7Q08962 181 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MSL5Q12186 476 aaKnown RBP RIP-Chip data7.89□□□□□ -1.15not detected
DDI1YER143W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W RTN2Q12443 393 aa7.89□□□□□ -1.15
DDI1YER143W CDC31P06704 161 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W STE12P13574 688 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W UTR1P21373 530 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MDH2P22133 377 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W CAM1P29547 415 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MCM10P32354 571 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PAU2P32612 120 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W AIM3P38266 947 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YBR137WP38276 179 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W IPI1P38803 334 aaPredicted RBP7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SER2P42941 309 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ATG18P43601 500 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W CCC1P47818 322 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PDR16P53860 351 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PLB2Q03674 706 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W GPN3Q06543 272 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YOL024WQ08172 172 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MCH4Q08268 501 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YOR378WQ08902 515 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ATG41Q12048 136 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W BAG7Q12128 409 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W TY1A-DR3Q12441 440 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SFG1Q12507 346 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YBL113CQ7M4S9 792 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa7.88□□□□□ -1.15
DDI1YER143W CDC9P04819 755 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W HIS3P06633 220 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PHO4P07270 312 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YFR010W-AP0C5N0 62 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ERG4P25340 473 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ADH7P25377 361 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MTH1P35198 433 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W TMA19P35691 167 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MIT1P40002 666 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YIL169CP40442 995 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SEC24P40482 926 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W NIT2P47016 307 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W LYS20P48570 428 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YGL204CP53089 101 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YGR066CP53242 292 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YKR005CQ02203 525 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PET191Q02772 108 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W TDA1Q03533 586 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W AIM36Q03798 255 aa7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W LYS21Q12122 440 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
DDI1YER143W TRA1P38811 3744 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PDX1P16451 410 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W STE18P18852 110 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W ERG24P32462 438 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data7.86□□□□□ -1.15not detected
DDI1YER143W KAE1P36132 386 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W MOH1P38191 138 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SDS24P38314 527 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W PHB1P40961 287 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W SLS1P42900 643 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W YJR120WP47157 116 aa7.86□□□□□ -1.15
DDI1YER143W DOC1P53068 250 aa7.86□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 59.3 ms