RNA–Protein interactions for RNA: YDL105W

NSE4, Transcript of Component of the SMC5-SMC6 complex, yeastyeast

Gene NSE4, Length 1,209 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NSE4YDL105W HIS2P38635 335 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YHL044WP38727 235 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W SMC2P38989 1170 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W AGP3P43548 558 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W HSH155P49955 971 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W PNC1P53184 216 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W COG7P53195 279 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W RSM27P53305 110 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W BCP1Q06338 283 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W TAZ1Q06510 381 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W RLP24Q07915 199 aaKnown RBP2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W POM33Q12164 279 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YAL063C-AQ3E791 96 aa2.17□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W ILV1P00927 576 aaKnown RBP2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YOL163WP0CF20 169 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W CDC42P19073 191 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W MRPL40P36534 297 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W MBA1P38300 278 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W VPS45P38932 577 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W AVT6P40074 448 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W SYS1P41544 203 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YGL088WP53151 121 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YNL260CP53846 198 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YPL113CQ02961 396 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W DPP1Q05521 289 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W YDL144CQ07589 356 aa2.16□□□□□ -2.06
NSE4YDL105W GAL7P08431 366 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MET2P08465 486 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W PHO80P20052 293 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W OSM1P21375 501 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YCR025CP25352 136 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W ALK2P32789 676 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W SPT4P32914 102 aaPredicted RBP2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W EBP2P36049 427 aaKnown RBP2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W GPI8P49018 411 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MRS2Q01926 470 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YML018CQ03730 393 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W ERV41Q04651 352 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W HRT1Q08273 121 aa2.15□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W ICL1P28240 557 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W SUA5P32579 426 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W PPQ1P32945 549 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W SEN34P39707 275 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W SHQ1P40486 507 aaPredicted RBP2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YNL050CP53952 270 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W OSH6Q02201 448 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W EGD1Q02642 157 aaKnown RBP2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W TAF9Q05027 157 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YLR413WQ06689 675 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YOR114WQ12219 294 aa2.14□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W DBP3P20447 523 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MIG1P27705 504 aa2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W SDH4P37298 181 aa2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W PHO89P38361 574 aa2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W AVT7P40501 490 aa2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W SWT21P53873 357 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W ERV25P54837 211 aaKnown RBP2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W ECM18Q04623 453 aa2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YLL007CQ07799 665 aa2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YPL150WQ12152 901 aa2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MRPL23Q12487 163 aaPredicted RBP2.13□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W RSA4P25382 515 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W KRE6P32486 720 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W UTR5P32630 166 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YKR032WP36127 104 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W TRM7P38238 310 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W GCD14P46959 383 aaPredicted RBP2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W RPE1P46969 238 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MIG2P53035 382 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W TPN1P53099 579 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W CPD1P53314 239 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W ALG9P53868 555 aaKnown RBP2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W TVP15Q03860 143 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W PRR2Q12310 699 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W TIM22Q12328 207 aa2.12□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YMR316C-AI2HB70 103 aa2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W OM45P16547 393 aa2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W CAT2P32796 670 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W COT1P32798 439 aa2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YBL081WP38180 368 aaKnown RBP2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W RTT105P40063 208 aa2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MEP1P40260 492 aa2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W MRX5P47007 382 aa2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YGL185CP53100 379 aa2.11□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W KRE1P17260 313 aa2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YSR3P23501 404 aa2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W CAM1P29547 415 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W CAB3P36076 571 aa2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W POP8P38208 133 aa2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W PEX18P38855 283 aa2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W VPS60Q03390 229 aa2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W NUP157P40064 1391 aaKnown RBP2.1□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W TDH2P00358 332 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W PET494P07390 489 aaPredicted RBP2.09□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W FRS2P15625 503 aaKnown RBP2.09□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W ERG2P32352 222 aa2.09□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YKL070WP36087 169 aa2.09□□□□□ -2.07
NSE4YDL105W YHI9P38765 294 aa2.09□□□□□ -2.07
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