RNA–Protein interactions for RNA: YCL028W

RNQ1, Transcript of [PIN(+)] prion, yeastyeast

Gene RNQ1, Length 1,218 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RNQ1YCL028W HMG1P12683 1054 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W RPC34P32910 317 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W VPS17P32913 551 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W MNN5P46982 586 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W YGL260WP53056 76 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W RSM24Q03976 319 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W GPI17Q04080 534 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W CTS2Q06350 511 aa9.94□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W IRA1P18963 3092 aa9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W MSW1P04803 379 aa9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W STE18P18852 110 aa9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W KRR1P25586 316 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W CAM1P29547 415 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W YEL057CP39983 233 aa9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W PMT6P42934 759 aa9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W NGL1Q08213 363 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W TMS1Q12116 473 aa9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W YHR214C-EQ8TGK0 99 aa9.93□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W PDE2P06776 526 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W DOA4P32571 926 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W ANR2P36090 516 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W RAI1P53063 387 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W IMO32P53219 342 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W ASI3P53983 676 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W YDR102CQ03864 110 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W HLR1Q04429 423 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W MRX8Q05473 314 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W NNT1Q05874 261 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SYC1Q08553 188 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W PEX27Q08580 376 aa9.92□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W GLT1Q12680 2145 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W CBP6P07253 162 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W MRP1P10662 321 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SPO7P18410 259 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W ERG9P29704 444 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W NPL6P32832 435 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W MTH1P35198 433 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SHE2P36068 246 aaKnown RBP RIP-Chip data9.91□□□□□ -0.82not detected
RNQ1YCL028W YBR137WP38276 179 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W RTT105P40063 208 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W CCC1P47818 322 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W MSY1P48527 492 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W PMT5P52867 743 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W CWC23P52868 283 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W KAP120Q02932 1032 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W TDA1Q03533 586 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W TSR2Q06672 205 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W TY1A-BLQ12266 440 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SUS1Q6WNK7 96 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W YBL113CQ7M4S9 792 aa9.91□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W COX9P07255 59 aa9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W ADH7P25377 361 aa9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SOF1P33750 489 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SPT10P35208 640 aa9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W PEX32P38292 413 aa9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W ATG18P43601 500 aa9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W ADO1P47143 340 aaKnown RBP9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W PET191Q02772 108 aa9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W SSY1Q03770 852 aa9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W TIR4Q12218 487 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
RNQ1YCL028W GCN4P03069 281 aa9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W MEK1P24719 497 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W PTC6P25646 442 aa9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W ZRT3P34240 503 aa9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W SER2P42941 309 aa9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W DPB11P47027 764 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W RMD9P53140 646 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W AIM36Q03798 255 aa9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W HRI1Q05905 244 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W SSK1Q07084 712 aa9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W LUC7Q07508 261 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W SOD2P00447 233 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W PAU2P32612 120 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W AIM3P38266 947 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W YHK8P38776 514 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W FCY21P40039 528 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W SLZ1P40167 298 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W TIR3P40552 269 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W YJR120WP47157 116 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W IMD3P50095 523 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W MSS11Q03825 758 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W RVB1Q03940 463 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W GAS2Q06135 555 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W YLR352WQ06479 807 aa9.88□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W NOP56Q12460 504 aaKnown RBP RIP-Chip data9.88□□□□□ -0.83not detected
RNQ1YCL028W QCR7P00128 127 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W RPS18AP0CX55 146 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W RPS18BP0CX56 146 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W TMA19P35691 167 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W CCZ1P38273 704 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W MGE1P38523 228 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W MIT1P40002 666 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W SLS1P42900 643 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W DOC1P53068 250 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W MRP51Q02950 344 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W MCH4Q08268 501 aa9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W RTC5Q12108 567 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
RNQ1YCL028W ADK1P07170 222 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 9.8 ms