RNA–Protein interactions for RNA: YBR217W

ATG12, Transcript of Ubiquitin-like modifier involved in autophagy and the Cvt pathway, yeast

Gene ATG12, Length 561 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG12	YBR217W	SLD3	P53135	668 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SAY1	P53324	424 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MNT4	P53745	580 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YNL165W	P53891	406 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	PET191	Q02772	108 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YMR315W	Q04869	349 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MCH4	Q08268	501 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	THI72	Q08579	599 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	NCE102	Q12207	173 aa	RIP-Chip data	5.06	□□□□□ -1.6	not detected
ATG12	YBR217W	MCT1	Q12283	360 aa		5.06	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	COX5B	P00425	151 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	IDP1	P21954	428 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	TIF3	P34167	436 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YKL187C	P34231	750 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SHE1	P38200	338 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SSZ1	P38788	538 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MDM31	P38880	579 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	IPT1	P38954	527 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	BUR6	P40096	142 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	PIG2	P40187	538 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	PDS1	P40316	373 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	TNA1	P53322	534 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	TIM10	P87108	93 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	TLG1	Q03322	224 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	AIM36	Q03798	255 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YDR387C	Q04162	555 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YMR087W	Q04299	284 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	AIM6	Q07716	390 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	RSC58	Q07979	502 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YOR378W	Q08902	515 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	FIT3	Q08907	204 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	ACF2	Q12168	779 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	IZH2	Q12442	317 aa		5.05	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MEK1	P24719	497 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	DBP2	P24783	546 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	ERG4	P25340	473 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	BOS1	P25385	244 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SUR1	P33300	382 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MED8	P38304	223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SDP1	P40479	209 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	TIR3	P40552	269 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MSS2	P40990	351 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	INN1	P53901	409 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YPL077C	Q02831	240 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	GSH2	Q08220	491 aa		5.04	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	PDE2	P06776	526 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	ECT1	P33412	323 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YLF2	P38746	405 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	AVT6	P40074	448 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	FMC1	P40491	155 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YIL029C	P40538	142 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YJL055W	P47044	245 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	LOH1	P47055	219 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	PPT1	P53043	513 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MTM1	P53320	366 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	DMA2	P53924	522 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	CRZ1	P53968	678 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	SKO1	Q02100	647 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	RSM28	Q03430	361 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	YLR346C	Q06139	101 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	BRE4	Q07660	1125 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	TMC1	Q08422	150 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	TRM10	Q12400	293 aa		5.03	□□□□□ -1.6
ATG12	YBR217W	MET17	P06106	444 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	ENA1	P13587	1091 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	DBF20	P32328	564 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	CLB6	P32943	380 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	DTR1	P38125	572 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	GVP36	P40531	326 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	PAM16	P42949	149 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	UBC13	P52490	153 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	ENA2	Q01896	1091 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	ARP10	Q04549	284 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	RNH1	Q04740	348 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	MRX8	Q05473	314 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	MRX10	Q05648	414 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	YLR173W	Q06247	608 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	FRE5	Q08908	694 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	ISU2	Q12056	156 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	RRI1	Q12468	440 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	ENA5	Q12691	1091 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	MED11	Q99278	115 aa		5.02	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	MES1	P00958	751 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	SCEI	P03882	235 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	DBF2	P22204	572 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	SPC29	P33419	253 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	CLG1	P35190	452 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	SPT10	P35208	640 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	MIA40	P36046	403 aa		5.01	□□□□□ -1.61
ATG12	YBR217W	SDS22	P36047	338 aa		5.01	□□□□□ -1.61

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