RNA–Protein interactions for RNA: Q0144

Q0144, Transcript of Dubious open reading frame, yeast

Gene Q0144, Length 330 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
Q0144	Q0144	PEP8	P40335	379 aa		1	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	COG7	P53195	279 aa		1	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	IRC4	Q03036	179 aa		1	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	CDC7	P06243	507 aa		0.99	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	CAT2	P32796	670 aa	Known RBP	0.99	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	SKI2	P35207	1287 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.99	□□□□□ -2.25	not detected
Q0144	Q0144	CAJ1	P39101	391 aa		0.99	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	YFL040W	P43562	540 aa		0.99	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	SPO24	Q3E752	67 aa		0.99	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	SGA1	P08019	549 aa		0.98	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	KRE6	P32486	720 aa		0.98	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	VAB2	P40003	282 aa		0.98	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	CAB5	Q03941	241 aa		0.98	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	STE23	Q06010	1027 aa		0.98	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	YOL019W	Q08157	551 aa		0.98	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	MCH2	P36032	473 aa		0.97	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	0.97	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	NUP49	Q02199	472 aa		0.97	□□□□□ -2.25
Q0144	Q0144	PUT1	P09368	476 aa		0.96	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	BMH1	P29311	267 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	YKR045C	P36138	183 aa		0.96	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	YHR035W	P38769	630 aa		0.96	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	GON7	P46984	123 aa		0.96	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	YMR114C	Q04471	368 aa	Known RBP	0.96	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	RAD7	P06779	565 aa		0.95	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	YNL143C	P53908	130 aa		0.95	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	BUR2	Q05949	395 aa		0.95	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	SFC1	P33303	322 aa		0.94	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	SPT8	P38915	602 aa		0.94	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	YGL114W	P53134	725 aa		0.94	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	MZM1	Q03429	123 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	NOT5	Q12514	560 aa	Predicted RBP	0.94	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	UBR2	Q07963	1872 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	PHO89	P38361	574 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	YNL146W	P53906	100 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	DAD3	P69850	94 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	ECM18	Q04623	453 aa		0.93	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	0.92	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	SWE1	P32944	819 aa		0.92	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	SEC28	P40509	296 aa	Known RBP	0.92	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	STE3	P06783	470 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	SCM4	P32564	187 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	LRP1	P38801	184 aa	Known RBP	0.91	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	YBL112C	Q3E7Y4	105 aa		0.91	□□□□□ -2.26
Q0144	Q0144	VPH1	P32563	840 aa	Known RBP	0.9	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	ZRT1	P32804	376 aa		0.9	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	AVT7	P40501	490 aa		0.9	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	YPL039W	Q03080	316 aa		0.9	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	ERG2	P32352	222 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	UBC13	P52490	153 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	YDR262W	Q12331	272 aa		0.89	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	DAD2	P36162	133 aa		0.88	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	YPC1	P38298	316 aa		0.88	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	SEN34	P39707	275 aa		0.88	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	YGR168C	P53293	376 aa		0.88	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	COT1	P32798	439 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	NBL1	Q3E7Y6	73 aa		0.87	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	POP8	P38208	133 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	CIS3	P47001	227 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	SWC4	P53201	476 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	PEX12	Q04370	399 aa		0.86	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	AEP1	P32493	518 aa		0.85	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	SHQ1	P40486	507 aa	Predicted RBP	0.85	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	SNX4	P47057	423 aa		0.85	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	0.84	□□□□□ -2.27
Q0144	Q0144	YHI9	P38765	294 aa		0.83	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	GLE2	P40066	365 aa		0.83	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	DRE2	P36152	348 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	ADH5	P38113	351 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	YHB1	P39676	399 aa	Known RBP	0.82	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	INA22	P40576	216 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	OKP1	P53298	406 aa		0.82	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	TAD2	P47058	250 aa		0.81	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	SKS1	Q12505	502 aa		0.81	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	RAS2	P01120	322 aa	Known RBP	0.8	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	DPB2	P24482	689 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	YGL010W	P25338	174 aa		0.8	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	0.8	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	IZH4	Q99393	312 aa		0.8	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	CSG2	P35206	410 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	DCN1	Q12395	269 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	MHT1	Q12525	324 aa		0.79	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	GDH2	P33327	1092 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	EOS1	P53938	366 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	PRM15	Q03262	622 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	SMT3	Q12306	101 aa	Known RBP	0.78	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	YPR064W	Q12492	139 aa		0.78	□□□□□ -2.28
Q0144	Q0144	ARN2	P38724	620 aa		0.77	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	TRM44	Q02648	567 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	RAD3	P06839	778 aa		0.76	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	FBA1	P14540	359 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	0.76	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	YBR220C	P38318	560 aa		0.76	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	YML018C	Q03730	393 aa		0.76	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	SAS5	Q99314	248 aa		0.76	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	GDS1	P41913	522 aa		0.75	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	AAH1	P53909	347 aa		0.75	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	TAZ1	Q06510	381 aa		0.75	□□□□□ -2.29
Q0144	Q0144	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	0.74	□□□□□ -2.29

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 109.4 ms