RNA–Protein interactions for RNA: YPR175W

DPB2, Transcript of Second largest subunit of DNA polymerase II (DNA polymerase epsilon), yeast

Gene DPB2, Length 2,070 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
DPB2	YPR175W	PFS1	P38872	237 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	MAM33	P40513	266 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	IZH4	Q99393	312 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	ESP1	Q03018	1630 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	RPB5	P20434	215 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	CBF5	P33322	483 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.95	□□□□□ -1.62	not detected
DPB2	YPR175W	MRX3	P38172	270 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SIP3	P38717	1229 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	TCD1	P38756	429 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PAN6	P40459	309 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	REE1	P40893	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	MOB2	P43563	287 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	TPN1	P53099	579 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PBA1	Q05778	276 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SFM1	Q12314	213 aa		4.95	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	IES6	P32617	166 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	DDI1	P40087	428 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YOR114W	Q12219	294 aa		4.94	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	UFD4	P33202	1483 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SDH3	P33421	198 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PRS2	P38620	318 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	HOC1	P47124	396 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SWC4	P53201	476 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	MRPS17	Q03246	237 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YMR317W	Q04893	1140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	IZH2	Q12442	317 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SNF8	Q12483	233 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SAC3	P46674	1301 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	MGM101	P32787	269 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	CSE1	P33307	960 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YKL071W	P36086	256 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	VAB2	P40003	282 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	TAD2	P47058	250 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PEX30	Q06169	523 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YMR230W-A	Q3E7B5	62 aa		4.93	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	HIS1	P00498	297 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	GPX1	P36014	167 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YBR241C	P38142	488 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	BAT1	P38891	393 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YJR054W	P47114	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	IBA57	P47158	497 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PEX31	P53203	462 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PRP38	Q00723	242 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SPO77	Q06134	477 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YPR172W	Q06608	200 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	NAM9	P27929	486 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	TPS1	Q00764	495 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	YPR064W	Q12492	139 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	HTZ1	Q12692	134 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	LTE1	P07866	1435 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	MET5	P47169	1442 aa		4.92	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	CDC25	P04821	1589 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PET494	P07390	489 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	ERD1	P16151	362 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SER33	P40510	469 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	HIT1	P46973	164 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	MAL13	P53338	473 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SNZ1	Q03148	297 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	GTO3	Q04806	366 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SFH1	Q06168	426 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	NAG1	Q8TGN9	163 aa		4.91	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	NAM2	P11325	894 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PBN1	P25580	416 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	DEP1	P31385	405 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	SRB4	P32569	687 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	CAB3	P36076	571 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	LSM12	P38828	187 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	CTF19	Q02732	369 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	PPT2	Q12036	173 aa		4.9	□□□□□ -1.62
DPB2	YPR175W	CTA1	P15202	515 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YER186C	P40101	306 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	NBP35	P52920	328 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SWS2	P53937	143 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	CRZ1	P53968	678 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SKI8	Q02793	397 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	DCR2	Q05924	578 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	GAS2	Q06135	555 aa		4.9	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	DNF1	P32660	1571 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	CDC50	P25656	391 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	INO2	P26798	304 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RIB1	P38066	345 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	YBR096W	P38256	230 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	SDS24	P38314	527 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	URA8	P38627	578 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	PTH1	P38876	190 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	RPC17	P47076	161 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	BIR1	P47134	954 aa		4.89	□□□□□ -1.63
DPB2	YPR175W	CLD1	P53264	445 aa		4.89	□□□□□ -1.63

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