RNA–Protein interactions for RNA: YOR367W

SCP1, Transcript of Component of yeast cortical actin cytoskeleton, yeast

Gene SCP1, Length 603 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SCP1	YOR367W	MOB2	P43563	287 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	HOC1	P47124	396 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	HOP2	P53187	214 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	VHT1	P53241	593 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	WSC2	P53832	503 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SUR7	P54003	302 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	DCR2	Q05924	578 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SFH1	Q06168	426 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SNA4	Q07549	140 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	ESA1	Q08649	445 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	TAF10	Q12030	206 aa		4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SME1	Q12330	94 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SPS100	P13130	326 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	IFM1	P25038	676 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	VPS21	P36017	210 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SDS24	P38314	527 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MIC12	P38341	106 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MDM31	P38880	579 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YJL213W	P40896	331 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YJR012C	P47087	207 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MTM1	P53320	366 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RSA1	Q08932	381 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	TFC7	Q12415	435 aa		4.64	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	NAM2	P11325	894 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MSI1	P13712	422 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RPB5	P20434	215 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SDH3	P33421	198 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RTC3	P38804	111 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YAT2	P40017	923 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SAD1	P43589	448 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	GLG2	P47011	380 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	LIF1	P53150	421 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	CDH1	P53197	566 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SHY1	P53266	389 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	CWC25	P53854	179 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	CDC14	Q00684	551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	GAS2	Q06135	555 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	HNT3	Q08702	217 aa		4.63	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YBR121C-A	P0C5L4	52 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	TCP1	P12612	559 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	CPR4	P25334	318 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	LDS1	P31379	325 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YKL187C	P34231	750 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	CBT1	P36038	271 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YER184C	P39961	794 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	AIM23	P47015	356 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	NBP1	P52919	319 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	ZRG17	P53735	605 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	FAR10	Q06001	478 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RIF2	Q06208	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SMD2	Q06217	110 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	TAZ1	Q06510	381 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MHR1	Q06630	226 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	AI5_BETA	Q9ZZX0	354 aa		4.62	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	POX1	P13711	748 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YMR31	P19955	123 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	URA10	P30402	227 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	ECM4	P36156	370 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	ERG28	P40030	148 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	VEL1	P53058	206 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	PEX31	P53203	462 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MAL13	P53338	473 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	FSH2	Q05015	223 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	TAF9	Q05027	157 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SRL1	Q08673	210 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YRA1	Q12159	226 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	ATP16	Q12165	160 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SFM1	Q12314	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YKL183C-A	Q3E765	70 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	LAG2	Q92325	660 aa		4.61	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RPL27A	P0C2H6	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RPL27B	P0C2H7	136 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MATALPHA2	P0CY08	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	HMLALPHA2	P0CY09	210 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	NAM9	P27929	486 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	PMT2	P31382	759 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	TPS2	P31688	896 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	PEX22	P39718	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YJR085C	P47131	105 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	IBA57	P47158	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	USE1	P53146	245 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	GMC1	Q04399	608 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	DPP1	Q05521	289 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	PEX30	Q06169	523 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	MHP1	P43638	1398 aa		4.6	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	HHF1	P02309	103 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RPP0	P05317	312 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	RPS3	P05750	240 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
SCP1	YOR367W	HOM6	P31116	359 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67

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