RNA–Protein interactions for RNA: YMR140W

SIP5, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene SIP5, Length 1,470 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP5	YMR140W	ECM7	Q06200	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	TPO3	Q06451	622 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SNA4	Q07549	140 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	LDB18	Q07887	179 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	THP1	Q08231	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	RAD28	Q12021	506 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SRO7	Q12038	1033 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SLM3	Q12093	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MRX4	Q12467	430 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MYO1	P08964	1928 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	TIM9	O74700	87 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SUC2	P00724	532 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	GAL4	P04386	881 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SEC12	P11655	471 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	GID7	P25569	745 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PEX34	P25584	144 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YCR090C	P25654	182 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YCR099C	P25657	155 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SUA7	P29055	345 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	CLB6	P32943	380 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YPT53	P36019	220 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	DTR1	P38125	572 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	FAU1	P40099	211 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	VMA21	P41806	77 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YJR012C	P47087	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YJR149W	P47177	404 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	DAN1	P47178	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YJR154W	P47181	346 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	AIF1	P52923	378 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SDT1	P53078	280 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	GTR2	P53290	341 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YPR003C	P53394	754 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	GPI15	P53961	229 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YSA1	Q01976	231 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	FIT1	Q04433	528 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	AIM33	Q04516	312 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PEX30	Q06169	523 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YLR179C	Q06252	201 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SKG3	Q06315	1026 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	RXT3	Q07458	294 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	ACK1	Q07622	623 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	HRD1	Q08109	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YPL260W	Q08977	551 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	TPO4	Q12256	659 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	RDI1	Q12434	202 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	TMA17	Q12513	150 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	CTF3	Q12748	733 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YPR145C-A	Q2V2P0	78 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YMR030W-A	Q3E760	96 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PET20	Q99373	253 aa		4.88	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	ILV1	P00927	576 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SPO7	P18410	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SRM1	P21827	482 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PET18	P25362	215 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	ADE1	P27616	306 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PEX4	P29340	183 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MSK1	P32048	576 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SFC1	P33303	322 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	FLO10	P36170	1169 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MRPL11	P36521	249 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	HSL7	P38274	827 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	HMS2	P47175	358 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MNN10	P50108	393 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PRM8	P53174	237 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YGR012W	P53206	393 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	TIM13	P53299	105 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	FMP41	P53889	259 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YPL014W	Q02606	381 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	VPS28	Q02767	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	EKI1	Q03764	534 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YAP6	Q03935	383 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	VBA1	Q04301	562 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SEN15	Q04675	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YLR446W	Q06204	433 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MMT2	Q08970	484 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PUF2	Q12221	1075 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.87	□□□□□ -1.63	RIP-Chip
SIP5	YMR140W	WTM1	Q12363	437 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	EAF3	Q12432	401 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	BI3	Q9ZZW7	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	FKS1	P38631	1876 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YEL009C-A	A0A023PZF2	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YOR304C-A	O14468	76 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	DED1	P06634	604 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	ERD2	P18414	219 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	ARE1	P25628	610 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MRP20	P32387	263 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	SEC17	P32602	292 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PHO11	P35842	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	RIB5	P38145	238 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	EHT1	P38295	451 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	YBR220C	P38318	560 aa		4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	MTC4	P38335	694 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
SIP5	YMR140W	PHO12	P38693	467 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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