RNA–Protein interactions for RNA: YMR089C

YTA12, Transcript of Mitochondrial inner membrane m-AAA protease component, yeast

Gene YTA12, Length 2,478 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YTA12	YMR089C	BMT5	P40493	336 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	AZR1	P50080	613 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	VEL1	P53058	206 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	MRPL51	Q06090	140 aa	Predicted RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SAM4	Q08985	325 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	APC9	Q12107	265 aa		4.63	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	GDA1	P32621	518 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SSH1	P38353	490 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YAL037W	P39728	267 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	AVT2	P39981	480 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SFH5	P47008	294 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	TY1A-MR1	Q04215	440 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	RIF2	Q06208	395 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YOL019W	Q08157	551 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	FUB1	P25659	250 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	MCH2	P36032	473 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	CYC2	P38909	366 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	IRC24	P40580	263 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	QRI1	P43123	477 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	TRS85	P46944	698 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	NBP35	P52920	328 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	VPS62	P53285	467 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YMR034C	Q05131	434 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ASA1	Q06822	443 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YPL225W	Q08971	146 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YOR338W	Q99326	363 aa		4.62	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SAT4	P25333	603 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	TRR1	P29509	319 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	IDP2	P41939	412 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	PRM10	P42946	383 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YGL235W	P53071	178 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	JAC1	P53193	184 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ASI1	P54074	624 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YET3	Q07451	203 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SFM1	Q12314	213 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	CYC1	P00044	109 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SIR3	P06701	978 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ITR2	P30606	609 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SKN1	P33336	771 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	LOS1	P33418	1100 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ECM15	P35195	104 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ECM8	P38246	354 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	COX15	P40086	486 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YIP4	P53093	235 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	NSA1	P53136	463 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	NPC2	Q12408	173 aa		4.61	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	TAO3	P40468	2376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	CPT1	P17898	393 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	TYR1	P20049	452 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	FLO10	P36170	1169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	IST2	P38250	946 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	POP1	P41812	875 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	COS4	P43542	379 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	TAD2	P47058	250 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ERG13	P54839	491 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YPQ1	Q12010	308 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	MLH3	Q12083	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	NSL1	Q12143	216 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ATG34	Q12292	412 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	RPB8	P20436	146 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SLM5	P25345	492 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YBR053C	P38235	358 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	MED8	P38304	223 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YFL012W	P43580	148 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	CIN2	P46670	268 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ALB1	P47019	175 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YJR054W	P47114	497 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SBH2	P52871	88 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	GPI15	P53961	229 aa		4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	RPN8	Q08723	338 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	STE4	P18851	423 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	RNA15	P25299	296 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ILV6	P25605	309 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.59	□□□□□ -1.67	not detected
YTA12	YMR089C	SWD2	P36104	329 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	COG3	P40094	801 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YCH1	P42937	148 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YDR132C	Q03900	495 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	YDR387C	Q04162	555 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	PLM2	Q04383	521 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	PRM6	Q04705	352 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	HRD3	Q05787	833 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	ACF2	Q12168	779 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SUT2	Q12286	268 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	DCN1	Q12395	269 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	MOT1	P32333	1867 aa		4.59	□□□□□ -1.67
YTA12	YMR089C	SUC2	P00724	532 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YTA12	YMR089C	AI3	P03877	415 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YTA12	YMR089C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.58	□□□□□ -1.68	not detected
YTA12	YMR089C	HEM15	P16622	393 aa		4.58	□□□□□ -1.68
YTA12	YMR089C	VPH2	P32341	215 aa		4.58	□□□□□ -1.68

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