RNA–Protein interactions for RNA: YMR017W

SPO20, Transcript of Meiosis-specific subunit of the t-SNARE complex, yeast

Gene SPO20, Length 1,194 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPO20	YMR017W	YLR446W	Q06204	433 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	YOR292C	Q08743	309 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	SIA1	Q12212	622 aa		3.18	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	RPL31A	P0C2H8	113 aa	Known RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	YBR062C	P38239	180 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	ASP1	P38986	381 aa	Predicted RBP	3.17	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	YIL059C	P40520	121 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	COS4	P43542	379 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	CPR7	P47103	393 aa		3.17	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	RPC25	P35718	212 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	GDS1	P41913	522 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	ERP3	Q12403	225 aa		3.16	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	PRP46	Q12417	451 aa	Predicted RBP	3.16	□□□□□ -1.9
SPO20	YMR017W	GPI12	P23797	304 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	IFM1	P25038	676 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	TPO5	P36029	618 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ARP5	P53946	755 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ACT1	P60010	375 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	SPO19	Q03029	223 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YPS3	Q12303	508 aa		3.15	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	VPH2	P32341	215 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	IMP3	P32899	183 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	MRPL6	P32904	214 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	AIM29	P36154	155 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	MRPL40	P36534	297 aa		3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	GCD14	P46959	383 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	PNC1	P53184	216 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	RRP42	Q12277	265 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	HPR1	P17629	752 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	UGA1	P17649	471 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YPL278C	Q08990	100 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YPR064W	Q12492	139 aa		3.13	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	DBP3	P20447	523 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	CSE1	P33307	960 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	RPC37	P36121	282 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	VAB2	P40003	282 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	KEL2	P50090	882 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YNL040W	P53960	456 aa	Predicted RBP	3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ECM18	Q04623	453 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	TAZ1	Q06510	381 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ASR1	Q06834	288 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YPL264C	Q08980	353 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	RFM1	Q12192	310 aa		3.12	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ATP6	P00854	259 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	CDC42	P19073	191 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YCR025C	P25352	136 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	CSM1	P25651	190 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YKL063C	P35725	167 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	VPS45	P38932	577 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	PCL7	P40186	285 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YIL012W	P40551	113 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	MPP10	P47083	593 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	GTO1	P48239	356 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	PEX30	Q06169	523 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		3.11	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	RPS23A	P0CX29	145 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	RPS23B	P0CX30	145 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	DAL80	P26343	269 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	RRF1	P38771	230 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YIA6	P40556	373 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YFL064C	P43540	174 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	AGP3	P43548	558 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YGL185C	P53100	379 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	LIF1	P53150	421 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YNL260C	P53846	198 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YNL050C	P53952	270 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	CSI1	Q04368	295 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ERV41	Q04651	352 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	GTO3	Q04806	366 aa		3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	SGT2	Q12118	346 aa	Known RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	MRPL23	Q12487	163 aa	Predicted RBP	3.1	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	IMP1	P28627	190 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	ARO4	P32449	370 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	GCG1	P32656	232 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	MRPL3	P36516	390 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	HIS2	P38635	335 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	PRP24	P49960	444 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YPT32	P51996	222 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	UFD1	P53044	361 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YPR063C	Q12160	140 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	POM33	Q12164	279 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	YIL002W-A	Q3E7Z5	69 aa		3.09	□□□□□ -1.91
SPO20	YMR017W	TFS1	P14306	219 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	IME2	P32581	645 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	MBA1	P38300	278 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	MED8	P38304	223 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	SPO73	P40031	143 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	DPP1	Q05521	289 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	BCP1	Q06338	283 aa		3.08	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	GAL7	P08431	366 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	DAL81	P21657	970 aa		3.07	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	PRE7	P23724	241 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
SPO20	YMR017W	SPT4	P32914	102 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92

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