RNA–Protein interactions for RNA: YMR001C-A

YMR001C-A, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YMR001C-A, Length 231 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR001C-AYMR001C-A PXR1P53335 271 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A SLM2P53955 656 aa0.92□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP0.92□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A VPH2P32341 215 aa0.91□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A MRPL6P32904 214 aa0.91□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A YIL089WP40500 205 aa0.91□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A YGR266WP53326 701 aa0.91□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A VPS9P54787 451 aa0.91□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A YLR012CQ07927 99 aa0.91□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A AGC1Q12482 902 aa0.91□□□□□ -2.26
YMR001C-AYMR001C-A HSP82P02829 709 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RDS1P25611 832 aa0.9□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A TRM7P38238 310 aaKnown RBP0.9□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A YPL150WQ12152 901 aa0.9□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A DPM1P14020 267 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RBK1P25332 333 aa0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A LRP1P38801 184 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A ALP1P38971 573 aa0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A BTT1P40314 149 aaPredicted RBP0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A YFL064CP43540 174 aa0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A TPN1P53099 579 aa0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RSM27P53305 110 aa0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A SXM1Q04175 944 aaKnown RBP0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A NNT1Q05874 261 aa0.89□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A STE3P06783 470 aa0.88□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A GRE3P38715 327 aaKnown RBP RIP-Chip data0.88□□□□□ -2.27not detected
YMR001C-AYMR001C-A SOP4P39543 234 aaPredicted RBP0.88□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A TAF6P53040 516 aa0.88□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A SPO77Q06134 477 aa0.88□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A SPO24Q3E752 67 aa0.88□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RGS2Q99188 309 aa0.88□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A IMP1P28627 190 aa0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A CDC13P32797 924 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A MBA1P38300 278 aa0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A SEC28P40509 296 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A PRP24P49960 444 aaKnown RBP0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A LIF1P53150 421 aa0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A ATG5Q12380 294 aa0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A LAG2Q92325 660 aa0.87□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A PAN1P32521 1480 aa0.86□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A GAL7P08431 366 aa0.86□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A PRP39P39682 629 aaKnown RBP0.86□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A PES4P39684 611 aa0.86□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RPA34P47006 233 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A COS6P53344 381 aa0.86□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A FCF1Q05498 189 aaPredicted RBP0.86□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RAD10P06838 210 aa0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A ADH5P38113 351 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A SPL2P38839 148 aa0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A AVT6P40074 448 aa0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A OST3P48439 350 aa0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A YNL143CP53908 130 aa0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A TVP15Q03860 143 aa0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RTC5Q12108 567 aaKnown RBP0.85□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A MRPL3P36516 390 aa0.84□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A GDT1P38301 280 aaPredicted RBP0.84□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A RSC1P53236 928 aa0.84□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A YOR268CQ08734 132 aa0.84□□□□□ -2.27
YMR001C-AYMR001C-A TDH1P00360 332 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A VMA5P31412 392 aaKnown RBP0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YHR045WP38775 560 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A SUR2P38992 349 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YFL040WP43562 540 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A MND1P53102 219 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A SWT21P53873 357 aaPredicted RBP0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A MRS2Q01926 470 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A SNX41Q04053 625 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A BUR2Q05949 395 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YLR446WQ06204 433 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A EMC6Q12431 108 aa0.83□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YCR102CP25608 368 aa0.82□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A TPO5P36029 618 aa0.82□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A CAB4P53332 305 aa0.82□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A IRC4Q03036 179 aa0.82□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A EBS1Q03466 884 aaKnown RBP0.82□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YDL144CQ07589 356 aa0.82□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A ACB1P31787 87 aa0.81□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A GCG1P32656 232 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A KRE29P40026 464 aa0.81□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YNL146WP53906 100 aa0.81□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A RVB1Q03940 463 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A UTP23Q12339 254 aaKnown RBP0.81□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A PUP2P32379 260 aa0.8□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YOR062CP36025 268 aa0.8□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YPC1P38298 316 aa0.8□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YLL007CQ07799 665 aa0.8□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A NUP157P40064 1391 aaKnown RBP0.8□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A DAD2P36162 133 aa0.79□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A VAB2P40003 282 aa0.79□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A MRPL49P40858 161 aaPredicted RBP0.79□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YGL114WP53134 725 aa0.79□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YGR016WP53209 190 aa0.79□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A FRE6Q12473 712 aa0.79□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YPL247CQ12523 523 aa0.79□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A TOM40P23644 387 aaKnown RBP0.78□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A MCH2P36032 473 aa0.78□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YDR089WP38966 869 aa0.78□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A COG3P40094 801 aa0.78□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A AVT7P40501 490 aa0.78□□□□□ -2.28
YMR001C-AYMR001C-A YGR168CP53293 376 aa0.78□□□□□ -2.28
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 47.3 ms