RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	ATP6	P00854	259 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RPL28	P02406	149 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RPS28B	P0C0X0	67 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ARF1	P11076	181 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NAM2	P11325	894 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	AMD1	P15274	810 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	URA6	P15700	204 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	AMD2	P22580	549 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ERG4	P25340	473 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ACB1	P31787	87 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	TCA17	P32613	152 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PPZ2	P33329	710 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MRPS5	P33759	307 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	BNA4	P38169	460 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ISC1	P40015	477 aa	Known RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	LAS21	P40367	830 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YJR054W	P47114	497 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MGA1	P53050	456 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	VEL1	P53058	206 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NMA2	P53204	395 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MKC7	P53379	596 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	AAT1	Q01802	451 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	GIP3	Q03016	1276 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	HSP31	Q04432	237 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YML053C	Q04978	212 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	BCH1	Q05029	724 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RIF2	Q06208	395 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	LDS2	Q08218	356 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	APC9	Q12107	265 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	USV1	Q12132	391 aa		4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RPS28A	Q3E7X9	67 aa	Predicted RBP	4.75	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SIR3	P06701	978 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ASP3-2	P0CX77	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ASP3-3	P0CX78	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ASP3-4	P0CX79	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ASP3-1	P0CZ17	362 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NHP6A	P11632	93 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	GCY1	P14065	312 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.74	□□□□□ -1.65	not detected
YMD8	YML038C	TVP38	P36164	337 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CUE1	P38428	203 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ANS1	P38832	159 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CHS7	P38843	316 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	GAA1	P39012	614 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	EDC3	P39998	551 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SHO1	P40073	367 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SLM1	P40485	686 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	BMT5	P40493	336 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PCI8	P40512	444 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	UFE1	P41834	346 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MDV1	P47025	714 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CCC1	P47818	322 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	COG2	P53271	262 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YGR151C	P53287	111 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	GTR2	P53290	341 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YPR003C	P53394	754 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	GOR1	P53839	350 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SNO1	Q03144	224 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ASA1	Q06822	443 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	ASR1	Q06834	288 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RPS10A	Q08745	105 aa	Predicted RBP	4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	NSL1	Q12143	216 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SFM1	Q12314	213 aa		4.74	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CHO1	P08456	276 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	IMA3	P0CW40	589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	IMA4	P0CW41	589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	TYR1	P20049	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	GDA1	P32621	518 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SKN1	P33336	771 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CLG1	P35190	452 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	TCM62	P38228	572 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	BDH1	P39714	382 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	HMF1	P40037	129 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	TRS85	P46944	698 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	LYS20	P48570	428 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MIC26	P50087	233 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	BUD17	P53727	317 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	DUG3	P53871	357 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YPL080C	Q02826	108 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YLR031W	Q07978	186 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RFU1	Q08003	200 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	IMA2	Q08295	589 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	POM33	Q12164	279 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YLL056C	Q12177	298 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	DCN1	Q12395	269 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	SET6	Q12529	373 aa		4.73	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PET54	P10834	293 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MBR1	P23493	339 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	PTP1	P25044	335 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	EHD3	P28817	500 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	MTR2	P34232	184 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	RPS10B	P46784	105 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YJR111C	P47148	283 aa	Known RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	JHD2	P47156	728 aa	Predicted RBP	4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	YIP4	P53093	235 aa		4.72	□□□□□ -1.65
YMD8	YML038C	CPD1	P53314	239 aa		4.72	□□□□□ -1.65

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