RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A TPM1P17536 199 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PET18P25362 215 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YPS1P32329 569 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A GCG1P32656 232 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A GPX1P36014 167 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YKL162CP36052 402 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YHL044WP38727 235 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SCC4P40090 624 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A ARC18Q05933 178 aaKnown RBP1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YLR446WQ06204 433 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PGC1Q08959 321 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A MRX4Q12467 430 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A DCP1Q12517 231 aaPredicted RBP1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A IZH4Q99393 312 aa1.58□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A TDH2P00358 332 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A CDC42P19073 191 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RPL16BP26785 198 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A MCH2P36032 473 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YKR032WP36127 104 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SSO2P39926 295 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SWC4P53201 476 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YDR286CQ05530 114 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YLR297WQ05899 129 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SAM4Q08985 325 aaKnown RBP1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YPR1Q12458 312 aa1.57□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YAK1P14680 807 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A KRE1P17260 313 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PRE7P23724 241 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RSA4P25382 515 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A CDC13P32797 924 aaKnown RBP1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A TPO5P36029 618 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SWC5P38326 303 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A END3P39013 349 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A AIM20P40451 204 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YFL064CP43540 174 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A LOH1P47055 219 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A COX16P47081 118 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A UBC13P52490 153 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YGR266WP53326 701 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A CAB5Q03941 241 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A VPS20Q04272 221 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A FEX1Q08913 375 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A FEX2Q08991 375 aa1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PFK27Q12471 397 aaPredicted RBP1.56□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A VPS1P21576 704 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RPL5P26321 297 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A MRPL3P36516 390 aa1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YIL012WP40551 113 aa1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PRP24P49960 444 aaKnown RBP1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RSM27P53305 110 aa1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PEX30Q06169 523 aa1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A CLP1Q08685 445 aaPredicted RBP1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YPL278CQ08990 100 aa1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A APC9Q12107 265 aa1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YAL063C-AQ3E791 96 aa1.55□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PHO80P20052 293 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A OPI1P21957 404 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A TRX1P22217 103 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A IMP3P32899 183 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YBR062CP38239 180 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YPC1P38298 316 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A FET3P38993 636 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A KRE29P40026 464 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A CDC40P40968 455 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SYS1P41544 203 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A MPP10P47083 593 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A OSH6Q02201 448 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A MIX17Q03667 156 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PBP4Q07362 185 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YDL144CQ07589 356 aa1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RRP42Q12277 265 aaPredicted RBP1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PAA1Q12447 191 aaKnown RBP1.54□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RPL31AP0C2H8 113 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A IMP1P28627 190 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A CAB3P36076 571 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SWD2P36104 329 aaPredicted RBP1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A VAB2P40003 282 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A AVT6P40074 448 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A GDS1P41913 522 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A BIO4P53630 237 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YNL095CP53932 642 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A PRO2P54885 456 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A NNT1Q05874 261 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RTC5Q12108 567 aaKnown RBP1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A SIA1Q12212 622 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A YPR064WQ12492 139 aa1.53□□□□□ -2.16
RPC10YHR143W-A RAD7P06779 565 aa1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A CAR2P07991 424 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A ZWF1P11412 505 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A GCD2P12754 651 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A SAR1P20606 190 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A OSM1P21375 501 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A YCR025CP25352 136 aa1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A ATG12P38316 186 aa1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A YDR089WP38966 869 aa1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A YER084WP40057 128 aa1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A RIB4P50861 169 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A VOA1P53262 265 aa1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A SYF2P53277 215 aaPredicted RBP1.52□□□□□ -2.17
RPC10YHR143W-A DBP6P53734 629 aaKnown RBP1.52□□□□□ -2.17
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