RNA–Protein interactions for RNA: YHR139C

SPS100, Transcript of Protein required for spore wall maturation, yeast

Gene SPS100, Length 981 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SPS100	YHR139C	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	7.74	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	HMS1	Q12398	434 aa		7.74	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	KIN28	P06242	306 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	YGL041W-A	P0C5N3	154 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	CPR2	P23285	205 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	ECT1	P33412	323 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	YKR015C	P36111	568 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	AMN1	P38285	549 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	MGE1	P38523	228 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	FMC1	P40491	155 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	MSY1	P48527	492 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	APM1	Q00776	475 aa	Predicted RBP	7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	RSM24	Q03976	319 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	BNA7	Q04066	261 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	YDL114W	Q07530	308 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	FMP45	Q07651	309 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	MIM1	Q08176	113 aa		7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	THP3	Q12049	470 aa	Known RBP	7.73	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	OPI3	P05375	206 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	STE50	P25344	346 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	FUN19	P28003	413 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	CAM1	P29547	415 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	SOF1	P33750	489 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	NVJ1	P38881	321 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	DDI1	P40087	428 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	YIL165C	P40446	119 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	SDP1	P40479	209 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	UBX6	P47049	396 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	HSV2	P50079	448 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	SOK2	P53438	785 aa	Predicted RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	YNR040W	P53736	256 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	KAP120	Q02932	1032 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	MAK3	Q03503	176 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	CTS2	Q06350	511 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	AIM6	Q07716	390 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	BAG7	Q12128	409 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	YHR214C-E	Q8TGK0	99 aa		7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	PRP8	P33334	2413 aa	Known RBP	7.72	□□□□□ -1.17
SPS100	YHR139C	SDS22	P36047	338 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	DTR1	P38125	572 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	AIM3	P38266	947 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	GPI16	P38875	610 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RIX1	P38883	763 aa	Predicted RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	IES5	P40060	125 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	IRC5	P43610	853 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	ADO1	P47143	340 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PLB2	Q03674	706 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YDR102C	Q03864	110 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	IPK1	Q06667	281 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YOR238W	Q08634	303 aa		7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PRS5	Q12265	496 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	SEC16	P48415	2195 aa	Known RBP	7.71	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MSW1	P04803	379 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RPS13	P05756	151 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	TAL1	P15019	335 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	SPO7	P18410	259 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YBR063C	P38083	404 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	CHS7	P38843	316 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PFS2	P42841	465 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PPT1	P53043	513 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	SAY1	P53324	424 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RVB1	Q03940	463 aa	Known RBP	7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	COQ11	Q05892	277 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YOR378W	Q08902	515 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	FRE5	Q08908	694 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YOL114C	Q12322	202 aa		7.7	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	GIT1	P25346	518 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	ARO7	P32178	256 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PUB1	P32588	453 aa	Known RBP RIP-Chip data	7.69	□□□□□ -1.18	not detected
SPS100	YHR139C	SRP102	P36057	244 aa	Predicted RBP	7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MRPL39	P36533	70 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	THI2	P38141	450 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	XBP1	P40489	647 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YMR265C	Q03508	461 aa	Known RBP	7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	ACF2	Q12168	779 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	COX17	Q12287	69 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YDL180W	Q12301	547 aa		7.69	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	HMG1	P12683	1054 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	STE18	P18852	110 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PUT3	P25502	979 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	KRR1	P25586	316 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	FUN26	P31381	517 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RPC34	P32910	317 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MTC2	P34246	357 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	DPB11	P47027	764 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PAU12	P53343	120 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MRP51	Q02950	344 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	GRX3	Q03835	250 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RBS1	Q05672	457 aa	Known RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	NNT1	Q05874	261 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	SYC1	Q08553	188 aa	Predicted RBP	7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	MED2	Q12124	431 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	TY1A-BL	Q12266	440 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	YPR1	Q12458	312 aa		7.68	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	PDE2	P06776	526 aa		7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	RPL24B	P24000	155 aa	Known RBP	7.67	□□□□□ -1.18
SPS100	YHR139C	BOS1	P25385	244 aa		7.67	□□□□□ -1.18

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 27.3 ms