RNA–Protein interactions for RNA: YHL024W

RIM4, Transcript of Putative RNA-binding protein, yeast

Gene RIM4, Length 2,142 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
RIM4	YHL024W	YPR003C	P53394	754 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YNR066C	P53752	436 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CUS2	P53830	285 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	DYN2	Q02647	92 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YPL077C	Q02831	240 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YPL108W	Q02872	168 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	EKI1	Q03764	534 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	GMC1	Q04399	608 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	APC4	Q04601	652 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CSM3	Q04659	317 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MDM30	Q05930	598 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BER1	Q06688	274 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ASA1	Q06822	443 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YLR036C	Q07986	203 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CRT10	Q08226	957 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SPC3	Q12133	184 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YOR342C	Q12182	319 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SNF8	Q12483	233 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PRM4	Q12498	284 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RPL9A	P05738	191 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	NUP1	P20676	1076 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	DAL2	P25335	343 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CSM1	P25651	190 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PEX4	P29340	183 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ERG9	P29704	444 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CST26	P38226	397 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	TAE1	P38340	232 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RRP4	P38792	359 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BIG1	P38813	335 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BUR6	P40096	142 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	LAS21	P40367	830 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MOG1	P47123	218 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RPL9B	P51401	191 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SGF73	P53165	657 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MPP6	P53725	186 aa	Predicted RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	AAT1	Q01802	451 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YPL071C	Q02864	156 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ODC1	Q03028	310 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YMR155W	Q03795	547 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	INM2	Q05533	292 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	FRQ1	Q06389	190 aa		3.56	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	HAP2	P06774	265 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	APE1	P14904	514 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	STE50	P25344	346 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	POF1	P25576	258 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	UBC8	P28263	218 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SPR1	P32603	445 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RRN10	P38204	145 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MLH1	P38920	769 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	HAT2	P39984	401 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	EFM3	P47163	339 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	FLC3	P53121	802 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	JAC1	P53193	184 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	PEX31	P53203	462 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YGR079W	P53249	370 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YNL010W	P53981	241 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RPA49	Q01080	415 aa	Predicted RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	NUP49	Q02199	472 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ATG21	Q02887	496 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CTL1	Q03220	320 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	FMN1	Q03778	218 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	GAL83	Q04739	417 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YDR222W	Q04925	415 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BLS1	Q06071	122 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YPR202W	Q08993	238 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	LCB4	Q12246	624 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	TAD3	Q9URQ3	322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	GAL80	P04387	435 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RHO1	P06780	209 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	QCR2	P07257	368 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MSF1	P08425	469 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	REV1	P12689	985 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SNF4	P12904	322 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	EXO70	P19658	623 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SCL1	P21243	252 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	RBK1	P25332	333 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SRB2	P34162	210 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YBR056W	P38081	501 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	AVT5	P38176	459 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	MMS21	P38632	267 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	LAG1	P38703	411 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	FSH1	P38777	243 aa	Known RBP	3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	END3	P39013	349 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YIL067C	P40514	678 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YJL107C	P42947	387 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	BST1	P43571	1029 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	INN1	P53901	409 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	SLM2	P53955	656 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	OAZ1	Q02803	292 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YPL113C	Q02961	396 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YML096W	Q04489	525 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CTS2	Q06350	511 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	CDD1	Q06549	142 aa		3.55	□□□□□ -1.84
RIM4	YHL024W	YLR413W	Q06689	675 aa		3.55	□□□□□ -1.84

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