RNA–Protein interactions for RNA: YFR027W

ECO1, Transcript of Acetyltransferase, yeast

Gene ECO1, Length 846 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ECO1	YFR027W	ARO9	P38840	513 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	VRG4	P40107	337 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PEP8	P40335	379 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GLC8	P41818	229 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	HXT14	P42833	540 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SNO3	P43544	222 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SIP4	P46954	829 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PHO86	P46956	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	NET1	P47035	1189 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YJR154W	P47181	346 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SOL1	P50278	321 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YML6	P51998	286 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PKP2	P53170	491 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	LSM7	P53905	115 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YNL134C	P53912	376 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	VPS9	P54787	451 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YSA1	Q01976	231 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	NUP49	Q02199	472 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YPL014W	Q02606	381 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MRP51	Q02950	344 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	DIG2	Q03373	323 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ATC1	Q04005	294 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CUE4	Q04201	117 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YMR130W	Q04223	302 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PRM6	Q04705	352 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TVP18	Q04767	167 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YDR278C	Q05612	105 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	LDB18	Q07887	179 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	REX4	Q08237	289 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PEX27	Q08580	376 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SCP1	Q08873	200 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GPM2	Q12008	311 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SLF1	Q12034	447 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YGK3	Q12222	375 aa	Predicted RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YLR126C	Q12288	251 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PST2	Q12335	198 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ERG27	Q12452	347 aa	Known RBP	3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	VMA9	Q3E7B6	73 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YER175W-A	Q8TGU4	54 aa		3.15	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RPS24A	P0CX31	135 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RPS24B	P0CX32	135 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	REV1	P12689	985 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PDX1	P16451	410 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	FUN14	P18411	198 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	BUB2	P26448	306 aa	Predicted RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YUR1	P26725	428 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	COQ3	P27680	312 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	NRP1	P32770	719 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.14	□□□□□ -1.91	not detected
ECO1	YFR027W	WBP1	P33767	430 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TVP38	P36164	337 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MRPL36	P36531	177 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RIB5	P38145	238 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ICS2	P38284	255 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RCK1	P38622	512 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	AVT2	P39981	480 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YMR147W	P40218	223 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ERR3	P42222	437 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	IBA57	P47158	497 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	NUP57	P48837	541 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MKC7	P53379	596 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ERV25	P54837	211 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MET14	Q02196	202 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	UBP16	Q02863	499 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RNY1	Q02933	434 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SLD5	Q03406	294 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YMR253C	Q04835	414 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YHC1	Q05900	231 aa	Known RBP	3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SSK1	Q07084	712 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YDL242W	Q07746	117 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	FDH1	Q08911	376 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YPL257W	Q08974	193 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YOL114C	Q12322	202 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ICT1	Q12385	394 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SNF8	Q12483	233 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PSF1	Q12488	208 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YGL194C-A	Q2V2P6	80 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YBR255C-A	Q3E776	120 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	YPR014C	Q6B0W2	109 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SUS1	Q6WNK7	96 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PET20	Q99373	253 aa		3.14	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ADH2	P00331	348 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	GAL4	P04386	881 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	HXK2	P04807	486 aa	Known RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	PRB1	P09232	635 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	3.13	□□□□□ -1.91	not detected
ECO1	YFR027W	SPO7	P18410	259 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	CDC42	P19073	191 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	MAK32	P23060	363 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	RRP7	P25368	297 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TAH1	P25638	111 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	ERG9	P29704	444 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TMT1	P32643	299 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TRS65	P32893	560 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	SKG6	P32900	734 aa	Predicted RBP	3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	COS9	P36034	407 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	DOA1	P36037	715 aa		3.13	□□□□□ -1.91
ECO1	YFR027W	TUL1	P36096	758 aa		3.13	□□□□□ -1.91

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