RNA–Protein interactions for RNA: YER103W

SSA4, Transcript of Heat shock protein that is highly induced upon stress, yeastyeast

Gene SSA4, Length 1,929 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SSA4YER103W BUB3P26449 341 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SSS1P35179 80 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W AZF1P41696 914 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PMT6P42934 759 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YGL117WP53133 265 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W ERV14P53173 138 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YPL108WQ02872 168 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MSC1Q03104 513 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W NMA1Q06178 401 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TFC7Q12415 435 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YKL033W-AQ86ZR7 236 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W HIS5P07172 385 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PZF1P39933 429 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W LSM4P40070 187 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W OCA1P50946 238 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W OCA2P53949 197 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YPD1Q07688 167 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W NDJ1Q12366 352 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YOR338WQ99326 363 aa11.76□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RPS21AP0C0V8 87 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RPB3P16370 318 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TIP1P27654 210 aaPredicted RBP11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MSK1P32048 576 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W ERG24P32462 438 aaKnown RBP11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SCM4P32564 187 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SGE1P33335 543 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W EDS1P38073 919 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W AVT5P38176 459 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W OCA5P38738 679 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TVP23P38962 199 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W AGX1P43567 385 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MEH1Q02205 184 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W REC102Q02721 264 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W CYK3Q07533 885 aa11.75□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YCR100CP25606 316 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W COS9P36034 407 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MMF1P40185 145 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TOK1P40310 691 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W LYS5P50113 272 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RSF1Q05043 376 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RBS1Q05672 457 aaKnown RBP11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YOR385WQ08909 290 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RAD28Q12021 506 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PUT3P25502 979 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W CNE1P27825 502 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SFA1P32771 386 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YJL068CP40363 299 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W VMA21P41806 77 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W DAN1P47178 298 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W COG7P53195 279 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YGR042WP53227 271 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YKR011CQ02209 353 aa11.74□□□□□ -0.53
SSA4YER103W COX9P07255 59 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W DPM1P14020 267 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W DOA1P36037 715 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SRP102P36057 244 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W DCW1P36091 449 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W LNP1P38878 278 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W EMC5P40540 141 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RTS2P40962 232 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W IDP2P41939 412 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PKP2P53170 491 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RSM27P53305 110 aa11.73□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RPS31P05759 152 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W CDC7P06243 507 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W UBI4P0CG63 381 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RPL40AP0CH08 128 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RPL40BP0CH09 128 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W ORC2P32833 620 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MSN4P33749 630 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YNK1P36010 153 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YJR141WP47172 347 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MAP1Q01662 387 aaKnown RBP RIP-Chip data11.72□□□□□ -0.53not detected
SSA4YER103W YLR257WQ06146 321 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MRI1Q06489 411 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TYW1Q08960 810 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PDH1Q12428 516 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YLR422WQ06409 1932 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YPK2P18961 677 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W BNA4P38169 460 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YEL068CP39977 110 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PFA3P42836 336 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TAX4P47030 604 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YGL101WP53144 215 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TYW3P53177 273 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W RTN1Q04947 295 aaKnown RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YPR109WQ06104 294 aa11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TFB5Q3E7C1 72 aaPredicted RBP11.72□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TDH2P00358 332 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W HOM2P13663 365 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SDH4P37298 181 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SOL1P50278 321 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W MNT2P53059 558 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W OKP1P53298 406 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W GPI15P53961 229 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W SRP1Q02821 542 aaKnown RBP11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PNG1Q02890 363 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W YMR206WQ03695 313 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W TPP1Q03796 238 aa11.71□□□□□ -0.53
SSA4YER103W PML1Q07930 204 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
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