RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)P

tW(CCA)P, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)P, Length 72 nt, Biotype tRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)PtW(CCA)P PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P COQ10Q08058 207 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P MIM1Q08176 113 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YOR238WQ08634 303 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P OSW1Q08692 278 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P FIT3Q08907 204 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RLM1Q12224 676 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RTR2Q12378 196 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P CCW14O13547 238 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P COX5BP00425 151 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P CDC4P07834 779 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P MSS18P08593 268 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P CLB2P24869 491 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P ERG4P25340 473 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P THI4P32318 326 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P HIS7P33734 552 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL107WP34251 309 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P ECM15P35195 104 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YKR015CP36111 568 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P DTR1P38125 572 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RTC2P38279 296 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS20P38701 121 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YHL044WP38727 235 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RPP1P38786 293 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P PEX18P38855 283 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P CTR2P38865 189 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P CTF8P38877 133 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P MSS4P38994 779 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YEL068CP39977 110 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P EGT2P42835 1041 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P HMS2P47175 358 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P MIG2P53035 382 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YGL235WP53071 178 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YGR168CP53293 376 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P RRN9P53437 365 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P MNT4P53745 580 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P ASI3P53983 676 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P GTR1Q00582 310 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P SED1Q01589 338 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P GTB1Q04924 702 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR127WQ06494 345 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P THI72Q08579 599 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P GRE1Q08969 168 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P SRL2Q12020 392 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P MCT1Q12283 360 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO24Q3E752 67 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)PtW(CCA)P SEC16P48415 2195 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPS13P05756 151 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SPO7P18410 259 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P STE18P18852 110 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SNF6P18888 332 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DBF2P22204 572 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P UBC8P28263 218 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CAM1P29547 415 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TRS65P32893 560 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RPC34P32910 317 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P CLB6P32943 380 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MSN4P33749 630 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.27□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)PtW(CCA)P YKL071WP36086 256 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SPC34P36131 295 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SKG1P36169 355 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P FZO1P38297 855 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SBE22P38814 852 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TIR3P40552 269 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YIR020CP40575 100 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P NCA3P46955 337 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YJL055WP47044 245 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SBH2P52871 88 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SCY1P53009 804 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MPP6P53725 186 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DSL1P53847 754 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DUG3P53871 357 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SVL3Q03088 825 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P TFB3Q03290 321 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P MSS11Q03825 758 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P RVB1Q03940 463 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P BNA7Q04066 261 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P NNT1Q05874 261 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P GGA1Q06336 557 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR040CQ07988 224 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P FRE8Q12209 686 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P NFI1Q12216 726 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YLR108CQ12259 485 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)PtW(CCA)P YPR015CQ12531 247 aa2.27□□□□□ -2.05
Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 25 ms