RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)K

tW(CCA)K, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)K, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)KtW(CCA)K PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K COQ10Q08058 207 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MIM1Q08176 113 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YOR238WQ08634 303 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K OSW1Q08692 278 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K FIT3Q08907 204 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RLM1Q12224 676 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RTR2Q12378 196 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CCW14O13547 238 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K COX5BP00425 151 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CDC4P07834 779 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MSS18P08593 268 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CLB2P24869 491 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ERG4P25340 473 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K THI4P32318 326 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K HIS7P33734 552 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL107WP34251 309 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ECM15P35195 104 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YKR015CP36111 568 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K DTR1P38125 572 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RTC2P38279 296 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS20P38701 121 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YHL044WP38727 235 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RPP1P38786 293 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K PEX18P38855 283 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CTR2P38865 189 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K CTF8P38877 133 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MSS4P38994 779 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YEL068CP39977 110 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K EGT2P42835 1041 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K HMS2P47175 358 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MIG2P53035 382 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YGL235WP53071 178 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YGR168CP53293 376 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K RRN9P53437 365 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MNT4P53745 580 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K ASI3P53983 676 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K GTR1Q00582 310 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SED1Q01589 338 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K GTB1Q04924 702 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR127WQ06494 345 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K THI72Q08579 599 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K GRE1Q08969 168 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SRL2Q12020 392 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K MCT1Q12283 360 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO24Q3E752 67 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)KtW(CCA)K SEC16P48415 2195 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RPS13P05756 151 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SPO7P18410 259 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K STE18P18852 110 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SNF6P18888 332 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DBF2P22204 572 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K UBC8P28263 218 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K CAM1P29547 415 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TRS65P32893 560 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RPC34P32910 317 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K CLB6P32943 380 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MSN4P33749 630 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.27□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)KtW(CCA)K YKL071WP36086 256 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SPC34P36131 295 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SKG1P36169 355 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K FZO1P38297 855 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SBE22P38814 852 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TIR3P40552 269 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YIR020CP40575 100 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K NCA3P46955 337 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YJL055WP47044 245 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SBH2P52871 88 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SCY1P53009 804 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MPP6P53725 186 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DSL1P53847 754 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DUG3P53871 357 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SVL3Q03088 825 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K TFB3Q03290 321 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K MSS11Q03825 758 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K RVB1Q03940 463 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K BNA7Q04066 261 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K NNT1Q05874 261 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K GGA1Q06336 557 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR040CQ07988 224 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K FRE8Q12209 686 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K NFI1Q12216 726 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YLR108CQ12259 485 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)KtW(CCA)K YPR015CQ12531 247 aa2.27□□□□□ -2.05
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