RNA–Protein interactions for RNA: tW(CCA)J

tW(CCA)J, Transcript of Tryptophan tRNA (tRNA-Trp), predicted by tRNAscan-SE analysis, yeastyeast

Gene tW(CCA)J, Length 72 nt, Biotype tRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
tW(CCA)JtW(CCA)J PML1Q07930 204 aaPredicted RBP2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J COQ10Q08058 207 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MIM1Q08176 113 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YOR238WQ08634 303 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J OSW1Q08692 278 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J FIT3Q08907 204 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RLM1Q12224 676 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RTR2Q12378 196 aa2.29□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CCW14O13547 238 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J COX5BP00425 151 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC40P07703 335 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CDC4P07834 779 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MSS18P08593 268 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PWP1P21304 576 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CLB2P24869 491 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ERG4P25340 473 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J KRR1P25586 316 aaPredicted RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J THI4P32318 326 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HIS7P33734 552 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL107WP34251 309 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ECM15P35195 104 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YKR015CP36111 568 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J DTR1P38125 572 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RTC2P38279 296 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS20P38701 121 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YHL044WP38727 235 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RPP1P38786 293 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J PEX18P38855 283 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CTR2P38865 189 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J CTF8P38877 133 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MSS4P38994 779 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RSP5P39940 809 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YEL068CP39977 110 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RLP7P40693 322 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J EGT2P42835 1041 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J HMS2P47175 358 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J IMD4P50094 524 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MIG2P53035 382 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YGL235WP53071 178 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YGR168CP53293 376 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J RRN9P53437 365 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MNT4P53745 580 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J ASI3P53983 676 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GTR1Q00582 310 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SED1Q01589 338 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GTB1Q04924 702 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR127WQ06494 345 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J THI72Q08579 599 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J NIP7Q08962 181 aaKnown RBP2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J GRE1Q08969 168 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SRL2Q12020 392 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J MCT1Q12283 360 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO24Q3E752 67 aa2.28□□□□□ -2.04
tW(CCA)JtW(CCA)J SEC16P48415 2195 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPS13P05756 151 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SPO7P18410 259 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J STE18P18852 110 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SNF6P18888 332 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DBF2P22204 572 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J UBC8P28263 218 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CAM1P29547 415 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DPH5P32469 300 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TRS65P32893 560 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RPC34P32910 317 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J CLB6P32943 380 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MSN4P33749 630 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PAD1P33751 242 aaKnown RBP RIP-Chip data2.27□□□□□ -2.05not detected
tW(CCA)JtW(CCA)J YKL071WP36086 256 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SPC34P36131 295 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SKG1P36169 355 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J FZO1P38297 855 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SBE22P38814 852 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J GDI1P39958 451 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TIR3P40552 269 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YIR020CP40575 100 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J PFS2P42841 465 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J NCA3P46955 337 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YJL055WP47044 245 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SBH2P52871 88 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SCY1P53009 804 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RMD9P53140 646 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MPP6P53725 186 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DSL1P53847 754 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DUG3P53871 357 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SVL3Q03088 825 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J TFB3Q03290 321 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J MSS11Q03825 758 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J RVB1Q03940 463 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J HMO1Q03973 246 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J BNA7Q04066 261 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J NNT1Q05874 261 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SNT309Q06091 175 aaPredicted RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J GGA1Q06336 557 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J DTD1Q07648 150 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR040CQ07988 224 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J SNX3Q08826 162 aaKnown RBP2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J FRE8Q12209 686 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J NFI1Q12216 726 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YLR108CQ12259 485 aa2.27□□□□□ -2.05
tW(CCA)JtW(CCA)J YPR015CQ12531 247 aa2.27□□□□□ -2.05
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