RNA–Protein interactions for RNA: YML031W

NDC1, Transcript of Subunit of the transmembrane ring of the nuclear pore complex (NPC), yeast

Gene NDC1, Length 1,968 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
NDC1	YML031W	SPT14	P32363	452 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	TEF4	P36008	412 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	IPI1	P38803	334 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	MIT1	P40002	666 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	DDI1	P40087	428 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YJR098C	P47139	656 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	DBP6	P53734	629 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	YLR126C	Q12288	251 aa		4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.66
NDC1	YML031W	HEM4	P06174	275 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YHR219W	P38900	624 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SHO1	P40073	367 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MPM1	P40364	252 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	LEM3	P42838	414 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SER2	P42941	309 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MSY1	P48527	492 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MAL12	P53341	584 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RIM13	Q03792	727 aa		4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	DBP9	Q06218	594 aa	Known RBP	4.65	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	CAP2	P13517	287 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	EHD3	P28817	500 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ASF2	P32448	525 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SEC61	P32915	480 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PPQ1	P32945	549 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YHL037C	P38733	133 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PCL6	P40038	420 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	QDR2	P40474	542 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YKE4	P40544	346 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PRM8	P53174	237 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YGR168C	P53293	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MRPL50	P53724	139 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MOT3	P54785	490 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	TIM10	P87108	93 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RRN5	Q02983	363 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YPL039W	Q03080	316 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SNX41	Q04053	625 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RAF1	Q06891	181 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YDL199C	Q12407	687 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NOP56	Q12460	504 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.64	□□□□□ -1.67	RIP-Chip
NDC1	YML031W	YBR298C-A	Q8TGK4	73 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	CDC4	P07834	779 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SEN2	P16658	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SEC2	P17065	759 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	UTR1	P21373	530 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MDH2	P22133	377 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ZRT3	P34240	503 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PRS3	P38689	320 aa	Known RBP	4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	VMA7	P39111	118 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SPO73	P40031	143 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GAT2	P40209	560 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YFR054C	P43622	192 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	EKI1	Q03764	534 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PEX27	Q08580	376 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YDL211C	Q12121	372 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YOR214C	Q12282	236 aa		4.64	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SAR1	P20606	190 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MRPL39	P36533	70 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YNL208W	P40159	199 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	PRE6	P40303	254 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	AVT7	P40501	490 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GPP1	P41277	250 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YFL066C	P43538	392 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SSY5	P47002	699 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GPI8	P49018	411 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MRH4	P53166	561 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	SCW11	P53189	542 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YNL181W	P53878	407 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YMD8	Q03697	442 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ATG38	Q05789	226 aa	Known RBP	4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MRL1	Q06815	381 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NPC2	Q12408	173 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YPR1	Q12458	312 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	Q0297	Q9ZZV8	51 aa		4.63	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	MER1	P16523	270 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RPC34	P32910	317 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	GLY1	P37303	387 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	BAP2	P38084	609 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ZTA1	P38230	334 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YBR242W	P38331	238 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RCK1	P38622	512 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	LAS21	P40367	830 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YGR210C	P42942	411 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	CAK1	P43568	368 aa	Predicted RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	TOM22	P49334	152 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	IGO1	P53897	168 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	NOG1	Q02892	647 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	API2	Q04413	109 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RNH1	Q04740	348 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	COX20	Q04935	205 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	ENB1	Q08299	606 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	FMP16	Q12497	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	LSO1	Q3E827	93 aa		4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	HTA1	P04911	132 aa	Known RBP	4.62	□□□□□ -1.67
NDC1	YML031W	YKL063C	P35725	167 aa		4.62	□□□□□ -1.67

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 20.7 ms