RNA–Protein interactions for RNA: YLR233C

EST1, Transcript of TLC1 RNA-associated factor involved in telomere length regulation, yeast

Gene EST1, Length 2,100 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
EST1	YLR233C	YRF1-4	O13559	1382 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	DOA4	P32571	926 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MYO3	P36006	1272 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SRP72	P38688	640 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YHR177W	P38867	453 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	FAD1	P38913	306 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CIS3	P47001	227 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPL37A	P49166	88 aa	Known RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MDM1	Q01846	1127 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YDR541C	Q03049	344 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SMP3	Q04174	516 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YOL075C	Q08234	1294 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YOR268C	Q08734	132 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MED1	Q12321	566 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MHP1	P43638	1398 aa		-0.06	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RAD7	P06779	565 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	GAL7	P08431	366 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RED1	P14291	827 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YGL010W	P25338	174 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	GFD2	P25370	566 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	EFB1	P32471	206 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CDC13	P32797	924 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	NFU1	P32860	256 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SFC1	P33303	322 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	BUD2	P33314	1104 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MRPS5	P33759	307 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	LCP5	P40079	357 aa	Predicted RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	LYS12	P40495	371 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SYS1	P41544	203 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPL10	P41805	221 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YJL016W	P47072	561 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	OST3	P48439	350 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPL37B	P51402	88 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RET3	P53600	189 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MRPL19	P53875	158 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SVL3	Q03088	825 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	AIM36	Q03798	255 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	APC5	Q08683	685 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	UAF30	Q08747	228 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PRM4	Q12498	284 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MDN1	Q12019	4910 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	UBR2	Q07963	1872 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	VAR1	P02381	398 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	FPR1	P20081	114 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ERV1	P27882	189 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	KRE6	P32486	720 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	AIM29	P36154	155 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MBA1	P38300	278 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YBR220C	P38318	560 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YHL026C	P38740	315 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SHC1	P39000	512 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	LSM5	P40089	93 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	NDE1	P40215	560 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YGL114W	P53134	725 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	LIF1	P53150	421 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YNR066C	P53752	436 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	DAD3	P69850	94 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YOR292C	Q08743	309 aa		-0.07	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RAD10	P06838	210 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPS16A	P0CX51	143 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPS16B	P0CX52	143 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ARF2	P19146	181 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ADK2	P26364	225 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SUR1	P33300	382 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	KAP104	P38217	918 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SPP381	P38282	291 aa	Predicted RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SPL2	P38839	148 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ATG7	P38862	630 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YDR089W	P38966	869 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PES4	P39684	611 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TIF34	P40217	347 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	GPD2	P41911	440 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YJL118W	P47022	219 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TCB2	P48231	1178 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MEH1	Q02205	184 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TVP15	Q03860	143 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CSM3	Q04659	317 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	IPK1	Q06667	281 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	YPR078C	Q06813	372 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	SFI1	Q12369	946 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	DCN1	Q12395	269 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	REP1	P03871	373 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PDE2	P06776	526 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CPA1	P07258	411 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	PUT1	P09368	476 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPL2A	P0CX45	254 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	RPL2B	P0CX46	254 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	TOM40	P23644	387 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	DBR1	P24309	405 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ERG9	P29704	444 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	MSK1	P32048	576 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	CAB5	Q03941	241 aa		-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ERB1	Q04660	807 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42
EST1	YLR233C	ARC18	Q05933	178 aa	Known RBP	-0.08	□□□□□ -2.42

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