RNA–Protein interactions for RNA: YLR219W

MSC3, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene MSC3, Length 2,187 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MSC3	YLR219W	YOL024W	Q08172	172 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	HRT1	Q08273	121 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PNS1	Q12412	539 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RPP2B	P02400	110 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YCL002C	P25565	263 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	EHD3	P28817	500 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	NIC96	P34077	839 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YER010C	P40011	234 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	ECL1	P48235	211 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	HOL1	P53389	586 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RRN9	P53437	365 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	BUD17	P53727	317 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	NUP49	Q02199	472 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SRP1	Q02821	542 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YMR087W	Q04299	284 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MIX14	Q04341	121 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	ARP10	Q04549	284 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YPQ2	Q06328	317 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YOR343C	Q12484	108 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SET6	Q12529	373 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YHR214C-D	P0CX93	97 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	NUP1	P20676	1076 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MDH3	P32419	343 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.05	□□□□□ -1.44	not detected
MSC3	YLR219W	SLC1	P33333	303 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MSN4	P33749	630 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YKR073C	P36153	106 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MDM31	P38880	579 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	NAS2	P40555	220 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MDE1	P47095	244 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	NQM1	P53228	333 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PBP1	P53297	722 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	FIN1	Q03898	291 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MRPL1	Q04599	285 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YPL191C	Q08930	360 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YGR161W-C	Q3E744	92 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	FET3	P38993	636 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SEC24	P40482	926 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	REE1	P40893	198 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SUT1	P53032	299 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	HNT3	Q08702	217 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RAS1	P01119	309 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PHO80	P20052	293 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	ADH7	P25377	361 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RPL5	P26321	297 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YHR035W	P38769	630 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YJR098C	P47139	656 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	EFM3	P47163	339 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	COS10	P52924	374 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	ELA1	P53861	379 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	TIM11	P81449	96 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RSA3	Q05942	220 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	UTP21	Q06078	939 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	TAZ1	Q06510	381 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	FLO9	P39712	1322 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	GAS1	P22146	559 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	AIM17	P23180	465 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RPS5	P26783	225 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PUP2	P32379	260 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PAD1	P33751	242 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.03	□□□□□ -1.44	not detected
MSC3	YLR219W	YKR015C	P36111	568 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MOH1	P38191	138 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SHO1	P40073	367 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YTA6	P40328	754 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YIL169C	P40442	995 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SSY5	P47002	699 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YGL260W	P53056	76 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YGR126W	P53274	230 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SDC1	Q03323	175 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SCS7	Q03529	384 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RRP9	Q06506	573 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MLC2	Q06580	163 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	FMP45	Q07651	309 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	IRC19	Q07843	230 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YDL176W	Q12027	708 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	TMS1	Q12116	473 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	RBD2	Q12270	262 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PCL9	Q12477	304 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MTR10	Q99189	972 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	CDC9	P04819	755 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MDH1	P17505	334 aa	Known RBP RIP-Chip data	6.03	□□□□□ -1.44	not detected
MSC3	YLR219W	NFS1	P25374	497 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SUR1	P33300	382 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MAL32	P38158	584 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SHE1	P38200	338 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	NTA1	P40354	457 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PRY1	P47032	299 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	SAM37	P50110	327 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	BRR6	P53062	197 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	MAL12	P53341	584 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	PDR16	P53860	351 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YLR173W	Q06247	608 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MSC3	YLR219W	YFR010W-A	P0C5N0	62 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MSC3	YLR219W	ATS1	P31386	333 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MSC3	YLR219W	APD1	P38281	316 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MSC3	YLR219W	OGG1	P53397	376 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
MSC3	YLR219W	MNT4	P53745	580 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MSC3	YLR219W	SUR7	P54003	302 aa		6.02	□□□□□ -1.45

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