RNA–Protein interactions for RNA: YKR041W

YKR041W, Transcript of Protein of unknown function, yeast

Gene YKR041W, Length 753 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YKR041W	YKR041W	BOP2	Q06150	570 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	XYL2	Q07993	356 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FRE5	Q08908	694 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YOR387C	Q08910	206 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YPQ1	Q12010	308 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	BSC1	Q12140	328 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PER33	Q12144	273 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TPO4	Q12256	659 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ATP14	Q12349	124 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FRE6	Q12473	712 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	LSO2	Q3E772	92 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FSH3	Q99369	266 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TRA1	P38811	3744 aa		4.96	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MDM35	O60200	86 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	LEU4	P06208	619 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PDA1	P16387	420 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CNB1	P25296	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RNA14	P25298	677 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HCM1	P25364	564 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FUN26	P31381	517 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PDC2	P32896	925 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ECT1	P33412	323 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CBP4	P37267	147 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GEP4	P38812	185 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CHL4	P38907	458 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TIM17	P39515	158 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HEM14	P40012	539 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FAU1	P40099	211 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ICE2	P40499	491 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CIN1	P40987	1014 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	BAP3	P41815	604 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ALK1	P43633	760 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	UBC9	P50623	157 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YGR250C	P53316	781 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SAY1	P53324	424 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GIM3	P53900	129 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PLB2	Q03674	706 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	OST6	Q03723	332 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YMR310C	Q04867	317 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YLR099W-A	Q3E798	87 aa		4.95	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TDH1	P00360	332 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	COX9	P07255	59 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MRP1	P10662	321 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	BAR1	P12630	587 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CMP2	P14747	604 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CKS1	P20486	150 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PDE1	P22434	369 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RFA2	P26754	273 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	NAM9	P27929	486 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	IDH2	P28241	369 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SRB6	P32570	121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	KKQ8	P36004	724 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YKL151C	P36059	337 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	DTR1	P38125	572 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HTD2	P38790	280 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	NSG1	P38837	291 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YER184C	P39961	794 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	HIS6	P40545	261 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MNT3	P40549	630 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TIR3	P40552	269 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YIR016W	P40572	265 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PRM10	P42946	383 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PHB2	P50085	310 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	COS12	P53053	380 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MEP3	P53390	489 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RSF1	Q05043	376 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PEX30	Q06169	523 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	LUC7	Q07508	261 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	AVO1	Q08236	1176 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	REX4	Q08237	289 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ZEO1	Q08245	113 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ALG6	Q12001	544 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YOR289W	Q12012	251 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	ATG41	Q12048	136 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TRM13	Q12383	476 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RDI1	Q12434	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YKL033W-A	Q86ZR7	236 aa		4.94	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GCD1	P09032	578 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FUS3	P16892	353 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PRP2	P20095	876 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MCK1	P21965	375 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RPA135	P22138	1203 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YSR3	P23501	404 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	LDS1	P31379	325 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PMT2	P31382	759 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CDC12	P32468	407 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	PAU2	P32612	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	GCS1	P35197	352 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MTH1	P35198	433 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	DOA1	P36037	715 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	TCD2	P36101	447 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YBR238C	P38330	731 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	SMB1	P40018	196 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	RAD17	P48581	401 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	FLC3	P53121	802 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	MTL1	P53214	551 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YGR045C	P53229	120 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	CAF40	P53829	373 aa		4.93	□□□□□ -1.62
YKR041W	YKR041W	YKR011C	Q02209	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 33.5 ms