RNA–Protein interactions for RNA: YKL061W

BLI1, Transcript of Subunit of the BLOC-1 complex involved in endosomal maturation, yeast

Gene BLI1, Length 342 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
BLI1	YKL061W	ITR2	P30606	609 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SWE1	P32944	819 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	BUD2	P33314	1104 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	JNM1	P36224	373 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	EDC2	P40023	145 aa	Predicted RBP	0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YIL089W	P40500	205 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	DSK2	P48510	373 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YNR066C	P53752	436 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	UTP6	Q02354	440 aa	Known RBP	0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YMR166C	Q03829	368 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CTS2	Q06350	511 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PRR2	Q12310	699 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SMC6	Q12749	1114 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YAL063C-A	Q3E791	96 aa		0.37	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YCR025C	P25352	136 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	ERG9	P29704	444 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SUR1	P33300	382 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MDL1	P33310	695 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CAB3	P36076	571 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YBR062C	P38239	180 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	NAB3	P38996	802 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.36	□□□□□ -2.35	not detected
BLI1	YKL061W	SYS1	P41544	203 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YHC3	P47040	408 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MIG2	P53035	382 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MLC1	P53141	149 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	MRX9	Q07349	420 aa	Known RBP	0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YFH1	Q07540	174 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	APC5	Q08683	685 aa		0.36	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	RPL26A	P05743	127 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	TFS1	P14306	219 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	DCC1	P25559	380 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CSE1	P33307	960 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PXA2	P34230	853 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	KTI12	P34253	313 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	GPX1	P36014	167 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PEX32	P38292	413 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YHL044W	P38727	235 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YHR122W	P38829	231 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YFR054C	P43622	192 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YJL027C	P47063	138 aa	Predicted RBP	0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	TPN1	P53099	579 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	RPL26B	P53221	127 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YGR266W	P53326	701 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YNR068C	P53754	272 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	CIK1	Q01649	594 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SPC19	Q03954	165 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	SUE1	Q06524	206 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	RDL2	Q08742	149 aa	Known RBP	0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YOR292C	Q08743	309 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	YPL150W	Q12152	901 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	PRM4	Q12498	284 aa		0.35	□□□□□ -2.35
BLI1	YKL061W	DPM1	P14020	267 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	MNE1	P24720	663 aa		0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	FAA1	P30624	700 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YBL028C	P38202	106 aa		0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YSW1	P38280	609 aa		0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	ALG9	P53868	555 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	FCF1	Q05498	189 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	AGC1	Q12482	902 aa		0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	PAR32	Q12515	295 aa	Known RBP	0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	DCP1	Q12517	231 aa	Predicted RBP	0.34	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	GAL7	P08431	366 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	MAS1	P10507	462 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	ZWF1	P11412	505 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	THR4	P16120	514 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	UBA1	P22515	1024 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	CIN8	P27895	1000 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	VMA8	P32610	256 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	COY1	P34237	679 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	MPE1	P35728	441 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	AIM29	P36154	155 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	TRM7	P38238	310 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	GRE3	P38715	327 aa	Known RBP RIP-Chip data	0.33	□□□□□ -2.36	not detected
BLI1	YKL061W	LSM4	P40070	187 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	OST3	P48439	350 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YML6	P51998	286 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	MPS2	P53159	387 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	CAB4	P53332	305 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	BIO4	P53630	237 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	HCH1	P53834	153 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	SLM2	P53955	656 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	UBX2	Q04228	584 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	GRH1	Q04410	372 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	SEC13	Q04491	297 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YPL245W	Q12179	454 aa	Known RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	ATG5	Q12380	294 aa		0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	PFK27	Q12471	397 aa	Predicted RBP	0.33	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	HXT2	P23585	541 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	SCO1	P23833	295 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	VPH2	P32341	215 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	MYO3	P36006	1272 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YMR134W	P40207	237 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YIL012W	P40551	113 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YFL064C	P43540	174 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YFL040W	P43562	540 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YJL055W	P47044	245 aa		0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	YJR141W	P47172	347 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	PXR1	P53335	271 aa	Predicted RBP	0.32	□□□□□ -2.36
BLI1	YKL061W	COS6	P53344	381 aa		0.32	□□□□□ -2.36

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